41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2527 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1315  hypothetical protein  84.49 
 
 		 420 aa  763    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.70067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00805  hypothetical protein  99.05 
 
 		 421 aa  872    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0970  hypothetical protein  98.34 
 
 		 421 aa  867    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0941  hypothetical protein  84.56 
 
 		 421 aa  760    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0881  putative cytoplasmic protein  84.32 
 
 		 421 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0991  putative cytoplasmic protein  84.56 
 
 		 421 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.720736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0970  hypothetical protein  85.04 
 
 		 421 aa  765    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0909  hypothetical protein  84.8 
 
 		 421 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2527  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  881    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00600019  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0846  hypothetical protein  97.86 
 
 		 421 aa  863    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0892  hypothetical protein  98.81 
 
 		 421 aa  871    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0879  hypothetical protein  98.57 
 
 		 421 aa  868    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00788  hypothetical protein  99.05 
 
 		 421 aa  872    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2821  protein of unknown function DUF1479  99.05 
 
 		 421 aa  872    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2727  hypothetical protein  50.49 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1445  hypothetical protein  50.49 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1333  hypothetical protein  50.49 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6329  hypothetical protein  45.58 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.86136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2192  putative cytoplasmic protein of unknown function(DUF1479)  45.37 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240391 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2463  hypothetical protein  45.43 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000168739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0511  hypothetical protein  45.32 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00707678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1633  putative dioxygenase  45.32 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00002202  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1841  putative dioxygenase  45.32 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000734173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1738  putative dioxygenase  45.32 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0566606  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0861  protein of unknown function DUF1479  44.39 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0160738  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2325  hypothetical protein  45.19 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0784  hypothetical protein  45.19 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.016275  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2144  hypothetical protein  45.43 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802554  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0669  dioxygenase, putative  45.1 
 
 		 414 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000518356  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4640  hypothetical protein  45.69 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3586  hypothetical protein  44.71 
 
 		 416 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3836  hypothetical protein  45.43 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.444137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3942  hypothetical protein  44.71 
 
 		 416 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4425  hypothetical protein  44.71 
 
 		 416 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3319  hypothetical protein  45.19 
 
 		 417 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.733251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3403  hypothetical protein  47.19 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04729  DUF1479 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09280)  33.33 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01480  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920378  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61764  predicted protein  28.23 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48836  predicted protein  27.57 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03660  conserved hypothetical protein  32.49 
 
 		 224 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>