27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1865 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1975  Putative mono-oxygenase ydhR  100 
 
 
101 aa  207  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1865  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  207  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00151494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1964  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  207  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415042  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1882  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  207  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1748  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  207  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000702806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1530  hypothetical protein  99.01 
 
 
101 aa  206  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186188  hitchhiker  0.000664342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01626  hypothetical protein  98.02 
 
 
101 aa  205  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.768197  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01636  hypothetical protein  98.02 
 
 
101 aa  205  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2380  hypothetical protein  98.02 
 
 
101 aa  202  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000551233  hitchhiker  0.00645865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3657  hypothetical protein  65.66 
 
 
103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3658  hypothetical protein  64.65 
 
 
103 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3731  hypothetical protein  64.65 
 
 
103 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.351793  normal  0.0833694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3766  hypothetical protein  64.65 
 
 
103 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.487018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2593  hypothetical protein  58.42 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0060  hypothetical protein  57.43 
 
 
104 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0544  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1052  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0208013  normal  0.0137552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0605  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.520017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3213  hypothetical protein  47 
 
 
101 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0562  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  104  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2918  hypothetical protein  46.94 
 
 
101 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2978  hypothetical protein  46.94 
 
 
101 aa  103  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0116181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3247  hypothetical protein  46.94 
 
 
101 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.307118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3218  hypothetical protein  45.92 
 
 
101 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3226  hypothetical protein  45.92 
 
 
101 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2990  hypothetical protein  45.92 
 
 
101 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.663111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2934  hypothetical protein  45.92 
 
 
102 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>