113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1392 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01202  nitrate reductase 1, alpha subunit  99.01 
 
 		 3744 bp  7081    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2421    99.09 
 
 		 3744 bp  7105    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00159409  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2259  nitrate reductase, alpha subunit  82.75 
 
 		 3807 bp  924    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2315  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  85.59 
 
 		 3744 bp  3124    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54501  normal  0.661113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01212    98.98 
 
 		 3743 bp  7065    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1334  nitrate reductase, alpha subunit  99.03 
 
 		 3744 bp  7089    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00293612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1375  nitrate reductase, alpha subunit  99.11 
 
 		 3744 bp  7113    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0266842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2883  nitrate reductase, alpha subunit  80.35 
 
 		 3723 bp  783    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.912631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2399  nitrate reductase, alpha subunit  99.01 
 
 		 3744 bp  7081    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000859704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1915  nitrate reductase 1, alpha subunit  96.64 
 
 		 3744 bp  6383    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0097675  normal  0.178347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1392    100 
 
 		 3723 bp  7380    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00324684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1895  nitrate reductase 1, alpha subunit  86.08 
 
 		 3744 bp  3267    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.5069  normal  0.259133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1959  nitrate reductase 1 subunit alpha  86.24 
 
 		 3744 bp  3314    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1900  nitrate reductase 1, alpha subunit  86.26 
 
 		 3744 bp  3322    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0962174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2564  nitrate reductase, alpha subunit  82.56 
 
 		 3762 bp  930    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1376  nitrate reductase 1, alpha subunit  86.16 
 
 		 3744 bp  3291    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0697293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1559  nitrate reductase 1 subunit alpha  86.05 
 
 		 3744 bp  3259    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.468525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1708  nitrate reductase 1, alpha subunit  98.31 
 
 		 3744 bp  6873    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0699868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1853  nitrate reductase, alpha subunit  82.62 
 
 		 3774 bp  498  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279909  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2188  nitrate reductase, alpha subunit  78.94 
 
 		 3741 bp  406  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1771  nitrate reductase, alpha subunit  81.55 
 
 		 3768 bp  406  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.654752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01426  nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit  78.89 
 
 		 3741 bp  402  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2179  nitrate reductase, alpha subunit  78.89 
 
 		 3741 bp  402  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.615849  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01438  hypothetical protein  78.89 
 
 		 3741 bp  402  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1649  nitrate reductase, alpha subunit  78.89 
 
 		 3771 bp  402  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1706  nitrate reductase 2, alpha subunit  78.65 
 
 		 3741 bp  375  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2078  nitrate reductase 2, alpha subunit  78.25 
 
 		 3741 bp  329  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1552  nitrate reductase, alpha subunit  85.41 
 
 		 3741 bp  311  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1755  nitrate reductase subunit alpha  79.29 
 
 		 3741 bp  268  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1584  nitrate reductase, alpha subunit  79.16 
 
 		 3741 bp  260  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1765  nitrate reductase subunit alpha  79.66 
 
 		 3741 bp  260  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2062  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  84.64 
 
 		 3741 bp  254  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1694  nitrate reductase, alpha subunit  78.91 
 
 		 3741 bp  244  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13780  putative respiratory nitrate reductase alpha subun  87.29 
 
 		 3786 bp  230  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1234  nitrate reductase subunit alpha  87.29 
 
 		 3786 bp  230  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.251816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1692  nitrate reductase, alpha subunit  83.58 
 
 		 3741 bp  228  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.821998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3086  nitrate reductase, alpha subunit  86.22 
 
 		 3744 bp  226  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1003  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  85.54 
 
 		 3759 bp  208  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1330  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  85.36 
 
 		 3783 bp  196  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2236  nitrate reductase, alpha subunit  85.71 
 
 		 3744 bp  190  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2706  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  85.5 
 
 		 3738 bp  167  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0398417  normal  0.0764072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2226  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  84.29 
 
 		 3765 bp  155  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.459309  normal  0.0879237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2302  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  84.29 
 
 		 3765 bp  155  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1581  nitrate reductase, alpha subunit  84.04 
 
 		 3735 bp  153  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2074  respiratory nitrate reductase subunit alpha apoprotein  86.23 
 
 		 3759 bp  149  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.393838  normal  0.347657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4595  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  84.92 
 
 		 3891 bp  141  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5684  nitrate reductase, alpha subunit  83.1 
 
 		 3759 bp  137  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3864  nitrate reductase, alpha subunit  84.44 
 
 		 3732 bp  135  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03847  nitrate reductase, alpha subunit  83.25 
 
 		 3426 bp  133  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0661  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  84.07 
 
 		 3828 bp  131  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1510  nitrate reductase, alpha subunit  83.33 
 
 		 3735 bp  131  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5383  nitrate reductase, alpha subunit  81.78 
 
 		 3777 bp  127  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.638499  normal  0.0486002 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0299  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  83.8 
 
 		 3765 bp  125  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242426  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0275  nitrate reductase, alpha subunit  83.8 
 
 		 3765 bp  125  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0974  respiratory nitrate reductase alpha chain oxidoreductase protein  84.12 
 
 		 3738 bp  123  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.35672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0666    81.01 
 
 		 3776 bp  123  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4669  nitrate reductase, alpha subunit  84.12 
 
 		 3738 bp  123  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3592  nitrate reductase, alpha subunit  84.12 
 
 		 3738 bp  123  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.292866  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1954  respiratory nitrate reductase alpha chain  80.93 
 
 		 3765 bp  121  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2592  nitrate reductase, alpha subunit  82.16 
 
 		 3759 bp  121  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2634  nitrate reductase, alpha subunit  84.93 
 
 		 3804 bp  115  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6464  nitrate reductase, alpha subunit  83.73 
 
 		 3846 bp  115  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692114  normal  0.779302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2520  nitrate reductase, alpha subunit  83.53 
 
 		 3756 bp  115  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.803235 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0122  nitrate reductase, alpha subunit  86.05 
 
 		 3804 bp  113  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1630  nitrate reductase, alpha subunit  86.05 
 
 		 3804 bp  113  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1545  nitrate reductase, alpha subunit  86.05 
 
 		 3804 bp  113  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5711  nitrate reductase, alpha subunit  82.95 
 
 		 3846 bp  111  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.539585 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2891  nitrate reductase, alpha subunit  81.6 
 
 		 3765 bp  111  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5002  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  82.42 
 
 		 3735 bp  107  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0436  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  81.19 
 
 		 3801 bp  107  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1109  nitrate reductase, alpha subunit  83.54 
 
 		 3840 bp  107  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1249  nitrate reductase, alpha subunit  84.67 
 
 		 3825 bp  105  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3761  nitrate reductase, alpha subunit  85.27 
 
 		 3831 bp  105  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0427  nitrate reductase, alpha subunit  84.67 
 
 		 3789 bp  105  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0622693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2792  nitrate reductase, alpha subunit  82.12 
 
 		 3819 bp  101  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1708  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  83.23 
 
 		 3807 bp  101  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2635  nitrate reductase, alpha subunit  84.5 
 
 		 3756 bp  97.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0605  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  83.57 
 
 		 3759 bp  95.6  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1731  nitrate reductase, alpha subunit  81.76 
 
 		 3747 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.987036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2757  nitrate reductase, alpha subunit  81.76 
 
 		 3747 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1854  nitrate reductase, alpha subunit  81.76 
 
 		 4026 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2241  nitrate reductase, alpha subunit  81.76 
 
 		 3726 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3077  nitrate reductase, alpha subunit  81.76 
 
 		 3726 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.49471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2625  nitrate reductase, alpha subunit  81.76 
 
 		 3726 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2681  nitrate reductase, alpha subunit  81.76 
 
 		 3726 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1514  nitrate reductase, alpha subunit  81.76 
 
 		 3726 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6184  nitrate reductase, alpha subunit  80.58 
 
 		 3795 bp  91.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1403  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  85.71 
 
 		 3759 bp  89.7  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2128  nitrate reductase, alpha subunit  79.91 
 
 		 3753 bp  89.7  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405432  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4236  nitrate reductase, alpha subunit  79.39 
 
 		 3765 bp  79.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340769  normal  0.474216 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1531  nitrate reductase, alpha subunit  85.71 
 
 		 3684 bp  73.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0970416  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1263  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  83.65 
 
 		 3684 bp  71.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0905318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1280  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  83.65 
 
 		 3684 bp  71.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0762629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1289  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  83.65 
 
 		 3684 bp  71.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0815258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0203  nitrate reductase, alpha subunit  90 
 
 		 3576 bp  71.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2652  nitrate reductase, alpha subunit  88.24 
 
 		 3582 bp  71.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2635  nitrate reductase, alpha subunit  85.54 
 
 		 3249 bp  69.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11186  respiratory nitrate reductase alpha subunit narG  83.18 
 
 		 3699 bp  69.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.109076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1924  Nitrate reductase  83.67 
 
 		 3546 bp  67.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1346  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  83 
 
 		 3723 bp  63.9  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>