11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0982 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0982    100 
 
 		 192 bp  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000190659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  100 
 
 		 1644 bp  379  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  100 
 
 		 1488 bp  379  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  100 
 
 		 1641 bp  379  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  100 
 
 		 1644 bp  379  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  97.38 
 
 		 1641 bp  339  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  97.38 
 
 		 1455 bp  339  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  95.81 
 
 		 1488 bp  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  95.81 
 
 		 1455 bp  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  84.11 
 
 		 1455 bp  77.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  82.18 
 
 		 1443 bp  58  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>