22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0265 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0265  inner membrane protein YkgB  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00258  conserved inner membrane protein  96.34 
 
 		 197 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00262  hypothetical protein  96.34 
 
 		 197 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0355  hypothetical protein  96.34 
 
 		 197 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0315  hypothetical protein  96.34 
 
 		 197 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3319  hypothetical protein  96.34 
 
 		 197 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0334  hypothetical protein  95.12 
 
 		 197 aa  158  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3302  protein of unknown function DUF417  95.12 
 
 		 197 aa  157  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0354  hypothetical protein  95.12 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0618  hypothetical protein  84.06 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.525105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0733  hypothetical protein  84.06 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0611  hypothetical protein  84.06 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0667  hypothetical protein  84.06 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0677  hypothetical protein  82.61 
 
 		 186 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1271  hypothetical protein  68.66 
 
 		 207 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.709898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4446  hypothetical protein  65.22 
 
 		 207 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2211  protein of unknown function DUF417  56.98 
 
 		 200 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510036  normal  0.18844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5270  protein of unknown function DUF417  48.65 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  normal  0.0500775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1294  hypothetical protein  52 
 
 		 191 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0133647  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1609  protein of unknown function DUF417  54.05 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.22956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2310  hypothetical protein  38.89 
 
 		 295 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3718  hypothetical protein  47.17 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00204077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>