27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0237 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0237  DNA-binding transcriptional regulator Crl  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00235  DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3341  DNA-binding transcriptional regulator Crl  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0272  DNA-binding transcriptional regulator Crl  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0267  DNA-binding transcriptional regulator Crl  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3367  transcriptional regulator Crl  99.25 
 
 
133 aa  274  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0285  DNA-binding transcriptional regulator Crl  99.25 
 
 
133 aa  274  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.45352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0294  DNA-binding transcriptional regulator Crl  98.5 
 
 
133 aa  273  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00238  hypothetical protein  98.5 
 
 
133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0349  DNA-binding transcriptional regulator Crl  84.21 
 
 
133 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0353  DNA-binding transcriptional regulator Crl  84.21 
 
 
133 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.832073  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0358  DNA-binding transcriptional regulator Crl  84.21 
 
 
133 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0360  DNA-binding transcriptional regulator Crl  84.21 
 
 
133 aa  241  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000254293 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0368  DNA-binding transcriptional regulator Crl  83.46 
 
 
133 aa  239  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.998647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0766  DNA-binding transcriptional regulator Crl  76.69 
 
 
133 aa  220  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0966  DNA-binding transcriptional regulator Crl  69.92 
 
 
133 aa  207  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3289  DNA-binding transcriptional regulator Crl  62.41 
 
 
133 aa  191  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405312  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3302  DNA-binding transcriptional regulator Crl  62.41 
 
 
133 aa  191  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000844173  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3151  DNA-binding transcriptional regulator Crl  61.65 
 
 
133 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.719284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3432  DNA-binding transcriptional regulator Crl  59.5 
 
 
124 aa  156  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3285  DNA-binding transcriptional regulator Crl  55.47 
 
 
124 aa  156  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0934  transcriptional regulator Crl  62.26 
 
 
119 aa  150  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0899  transcriptional regulator Crl  62.62 
 
 
119 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01161  DNA-binding transcriptional regulator Crl  45.87 
 
 
135 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1865  DNA-binding transcriptional regulator Crl  46.53 
 
 
129 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000381316  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004269  transcriptional regulator Crl  45.87 
 
 
129 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00560329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2954  DNA-binding transcriptional regulator Crl  33.33 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.405401  normal  0.114095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>