100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0238 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0238    100 
 
 		 186 bp  369  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0074    100 
 
 		 186 bp  369  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314733  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0012    100 
 
 		 186 bp  369  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0003    100 
 
 		 186 bp  369  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 366 bp  363  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  100 
 
 		 366 bp  363  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  100 
 
 		 366 bp  363  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  100 
 
 		 366 bp  363  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 366 bp  363  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 366 bp  363  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 366 bp  363  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 366 bp  363  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 366 bp  363  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  99.46 
 
 		 366 bp  361  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  99.46 
 
 		 366 bp  361  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0517    99.46 
 
 		 186 bp  361  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0387    99.46 
 
 		 1229 bp  361  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  96.77 
 
 		 366 bp  321  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  95.16 
 
 		 411 bp  297  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  95.16 
 
 		 411 bp  297  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  95.16 
 
 		 411 bp  297  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  95.16 
 
 		 366 bp  297  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  95.16 
 
 		 411 bp  297  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  95.16 
 
 		 366 bp  297  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  95.16 
 
 		 411 bp  297  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  95.16 
 
 		 411 bp  297  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1562    100 
 
 		 138 bp  274  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4787    91.14 
 
 		 480 bp  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3227    96.19 
 
 		 300 bp  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4089    100 
 
 		 387 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.912238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4356  transposase InsD for insertion element IS2A/D/F/H/I/K  100 
 
 		 552 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  100 
 
 		 912 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  100 
 
 		 912 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3226    100 
 
 		 582 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  85.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0516    97.67 
 
 		 369 bp  77.8  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3629  IS2 transposase  97.67 
 
 		 315 bp  77.8  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  97.67 
 
 		 906 bp  77.8  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0007  IS2, transposase orfB, truncation  97.67 
 
 		 252 bp  77.8  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  83.53 
 
 		 267 bp  58  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  83.53 
 
 		 369 bp  58  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  83.53 
 
 		 369 bp  58  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  83.53 
 
 		 366 bp  58  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  88.24 
 
 		 258 bp  54  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  82.35 
 
 		 369 bp  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  79.83 
 
 		 369 bp  46.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6581    93.55 
 
 		 96 bp  46.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0700613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>