23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0079 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0079    100 
 
 		 180 bp  357  6.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.47406e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3145    99.36 
 
 		 321 bp  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4275  ISSfl4 ORF2  98.73 
 
 		 348 bp  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.935918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  83.8 
 
 		 348 bp  99.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  87.37 
 
 		 348 bp  93.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  87.37 
 
 		 348 bp  93.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  87.37 
 
 		 348 bp  93.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  87.37 
 
 		 348 bp  93.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  87.37 
 
 		 348 bp  93.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  87.37 
 
 		 348 bp  93.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4985    88.64 
 
 		 183 bp  48.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  88.64 
 
 		 351 bp  48.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  93.75 
 
 		 387 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  100 
 
 		 348 bp  48.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  93.75 
 
 		 348 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  93.75 
 
 		 327 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  93.75 
 
 		 327 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  93.75 
 
 		 348 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  93.75 
 
 		 348 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  93.75 
 
 		 348 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  93.75 
 
 		 348 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  93.75 
 
 		 348 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  93.75 
 
 		 348 bp  48.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>