293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0045 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00211  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00313  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00340  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00503    98.68 
 
 		 1860 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00571  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00587  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01115    98.41 
 
 		 1689 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01117  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01242    98.68 
 
 		 2672 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01934  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02040  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02270  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02450    98.68 
 
 		 2195 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02645    98.41 
 
 		 1425 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02646  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02823  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000374053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03226    98.41 
 
 		 1863 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03483    98.41 
 
 		 1673 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03484  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04163  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.636696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04180  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04209  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04214    98.68 
 
 		 2201 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.611997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04281  IS1 protein InsB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0271    98.15 
 
 		 698 bp  694    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2655    98.94 
 
 		 698 bp  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3331    98.94 
 
 		 698 bp  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3341    98.94 
 
 		 698 bp  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.720184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3576    98.41 
 
 		 698 bp  702    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000806307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3685    98.41 
 
 		 698 bp  702    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.406239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3780    98.41 
 
 		 698 bp  702    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4691  hypothetical protein  98.41 
 
 		 504 bp  702    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000333815  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0065  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1074  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0868    99.74 
 
 		 504 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1900  IS1, transposase orfB  97.88 
 
 		 504 bp  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2701  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2761  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000020143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2922  IS1, transposase orfB  97.88 
 
 		 504 bp  686    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3007  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000875521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3091  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0330  IS1, transposase orfB  98.15 
 
 		 504 bp  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3316  IS1, transposase orfB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3802    98.41 
 
 		 698 bp  702    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0544  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0507  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0457  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.689763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0434  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0285  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0702    99.74 
 
 		 504 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0766    98.15 
 
 		 505 bp  688    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.742167  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0958  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 378 bp  749    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0022818  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0798    99.74 
 
 		 504 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.156959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0787    99.74 
 
 		 504 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0062101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  97.62 
 
 		 698 bp  678    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  99.21 
 
 		 698 bp  726    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0949  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0561659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0876    100 
 
 		 504 bp  749    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.853635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0623  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0281  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 504 bp  749    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0862  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.537368  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0104  IS1 transposase orfB  98.94 
 
 		 504 bp  718    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00262405  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1222  IS1 transposase orfB  99.47 
 
 		 378 bp  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.143606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  98.68 
 
 		 504 bp  710    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2252  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.657122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  98.41 
 
 		 504 bp  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1101    99.74 
 
 		 504 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0852  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.157864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0820  IS1 transposase orfB  99.74 
 
 		 378 bp  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>