107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3456 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3456  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  100 
 
 
110 aa  232  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2821  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.81 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1840  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.05 
 
 
113 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798586  normal  0.240936 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3574  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.96 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0326  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.18 
 
 
144 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00145038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3630  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.21 
 
 
115 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4277  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.65 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3339  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.91 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.456035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43250  hypothetical protein  32.46 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.708764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4109  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.74 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.055952  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2158  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.93 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0585647  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4111  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.13 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000937447  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3305  hypothetical protein  34.21 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0278022  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4074  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.58 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2957  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.53 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.383141  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3500  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.09 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1704  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5355  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.07 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.922702  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2241  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.04 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.451684  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.3 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2699  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.73 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176555  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0256  hypothetical protein  30.97 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2417  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.86 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2693  hypothetical protein  30.97 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2465  hypothetical protein  30.97 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0919  hypothetical protein  30.97 
 
 
207 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2384  hypothetical protein  30.97 
 
 
212 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2056  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.14 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.240914  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0753  hypothetical protein  30.09 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2253  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.25 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.233801  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.97 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107279  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5543  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.83 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0741  hypothetical protein  30.09 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4837  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.43 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0635  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.74 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379764  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1238  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.95 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3297  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.03 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4603  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.19 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4549  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.55 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357845  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4402  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.89 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302745  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2164  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.61 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2052  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.2 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2663  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.2 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2716  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.2 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2807  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.3 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2588  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.2 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1191  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.82 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5991  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.32 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2565  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.61 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2692  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.32 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0419  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.09 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.820444  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0606  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.29 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3374  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.03 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2171  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1655  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290612  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1607  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.19 
 
 
123 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0497  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1669  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.78 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03740  hypothetical protein  28.7 
 
 
130 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183645  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000951  gfa-like protein  33.96 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4872  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.71 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1218  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.78 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1697  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.78 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3558  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.41 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1629  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.26 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1442  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0522  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.33 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.288111  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7106  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.53 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3235  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.96 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0403  hypothetical protein  31.73 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5593  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.44 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.876476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1327  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.69 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06993  hypothetical protein  38.96 
 
 
131 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0612  hypothetical protein  31.08 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2193  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.75 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.91 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3856  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.53 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2817  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3804  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.53 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.65 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5167  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.52 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.578961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2168  hypothetical protein  30 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.327259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3356  hypothetical protein  29.73 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217164  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.33 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28950  hypothetical protein  34.57 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.906248  hitchhiker  0.0000303722 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0840  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1550  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.47 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0199849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.11 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.189147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3911  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.65 
 
 
130 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4052  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0219  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.17 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.655327  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2783  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.25 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0569406  hitchhiker  0.000528708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3257  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.82 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0088  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.63 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4010  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.63 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0087  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.63 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4618  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.01 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2724  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.7 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4001  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>