More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3401 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3401  major facilitator transporter  100 
 
 		 447 aa  875    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 433 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  39.31 
 
 		 445 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 440 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  40 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 442 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  37.59 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  36.83 
 
 		 443 aa  256  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  35.8 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 462 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 424 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 449 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  38.82 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 453 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 440 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 466 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  36.98 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  36.75 
 
 		 437 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  33.49 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  37.56 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  37.25 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 441 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2926  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 440 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  30.87 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  30.87 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  30.87 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  30.87 
 
 		 458 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  30.65 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 439 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  36.32 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0632  4-hydroxyphenylacetate transporter  31.96 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.862477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  34.89 
 
 		 440 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 443 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 440 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 434 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 441 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5847  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.677532  hitchhiker  0.000346248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  30.09 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  34.11 
 
 		 469 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 434 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  30.09 
 
 		 458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  30.09 
 
 		 458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  30.09 
 
 		 458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.11 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  34.11 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  34.11 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  34.11 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  34.11 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 442 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 442 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 441 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 441 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 447 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  36.14 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  34.38 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>