42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1184 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1184  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative  100 
 
 
313 aa  632  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  35.04 
 
 
290 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  31.4 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  34.04 
 
 
275 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  36.41 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 
336 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  33.78 
 
 
299 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  31.72 
 
 
268 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  32.04 
 
 
482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1078  TM1410 hypothetical-related protein  31.09 
 
 
279 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.494543 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  28.99 
 
 
314 aa  99  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  29.77 
 
 
293 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  30.4 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3951  hypothetical protein  30.65 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  29.9 
 
 
359 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  21.04 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  34.68 
 
 
430 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  25.25 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  38.67 
 
 
457 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  65.91 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  37.66 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  53.85 
 
 
875 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  28.57 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  60.53 
 
 
1281 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  45.65 
 
 
1050 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2496  hypothetical protein  45.83 
 
 
415 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  30.63 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  30.43 
 
 
489 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  50 
 
 
1694 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  56.1 
 
 
1409 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  23.92 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  56 
 
 
771 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  53.19 
 
 
431 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0736  cellulosome anchoring protein, cohesin region  39.06 
 
 
1305 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.4308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  66.67 
 
 
1034 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  44.07 
 
 
1279 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  49.12 
 
 
628 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  57.5 
 
 
914 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  40 
 
 
504 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  37.5 
 
 
1110 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  65.71 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  62.16 
 
 
846 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>