More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0581 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0581  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
375 aa  756    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680439  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2019  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.58 
 
 
377 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3620  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  66.58 
 
 
377 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.5 
 
 
388 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.52 
 
 
395 aa  358  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.39 
 
 
385 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.49 
 
 
371 aa  346  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.91 
 
 
387 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.38 
 
 
389 aa  335  9e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.65 
 
 
404 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0809  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.17 
 
 
392 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.65 
 
 
404 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.13 
 
 
388 aa  328  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.41 
 
 
389 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.13 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 
397 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.88 
 
 
388 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.26 
 
 
397 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.86 
 
 
387 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3068  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.91 
 
 
389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.76584  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.24 
 
 
381 aa  317  2e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.53 
 
 
392 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7333  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.03 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.4 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0449  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.47 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.408478 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.75 
 
 
382 aa  312  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3697  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.29 
 
 
411 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1128  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.87 
 
 
380 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2996  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.25 
 
 
381 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.343819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.7 
 
 
395 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.71 
 
 
426 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1021  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.22 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000463021 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.09 
 
 
395 aa  308  8e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0012  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.21 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.62 
 
 
395 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.62 
 
 
395 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0048  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.6 
 
 
380 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1338  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.16 
 
 
390 aa  300  3e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.15 
 
 
387 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.37 
 
 
398 aa  295  6e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.85 
 
 
388 aa  295  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3336  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.67 
 
 
383 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0627884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2093  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.65 
 
 
363 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal  0.304299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.41 
 
 
376 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4235  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.7 
 
 
396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.67 
 
 
383 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4745  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.01 
 
 
410 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.12 
 
 
379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.28 
 
 
383 aa  282  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1895  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.65 
 
 
383 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387687  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1668  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.85 
 
 
401 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0474135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1420  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.58 
 
 
383 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000737808  normal  0.0270135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.18 
 
 
391 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.18 
 
 
391 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.94 
 
 
386 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.74 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.28 
 
 
425 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.98 
 
 
386 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.12 
 
 
378 aa  272  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.78 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.02 
 
 
391 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1933  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.65 
 
 
379 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.25 
 
 
379 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0277  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.74 
 
 
401 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.65 
 
 
379 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1245  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.12 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5341  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.85 
 
 
379 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964134  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1263  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.98 
 
 
386 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103689  normal  0.466202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2518  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.92 
 
 
382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00740773 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2051  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.85 
 
 
379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1327  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.53 
 
 
383 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158007  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.4 
 
 
391 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6045  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.24 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.790399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2032  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.24 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460385  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.91 
 
 
375 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2482  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.73 
 
 
389 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.69 
 
 
375 aa  265  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.95 
 
 
380 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.4 
 
 
375 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2014  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.03 
 
 
383 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.466728  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.33 
 
 
395 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.91 
 
 
375 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2451  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.03 
 
 
379 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.684558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2507  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.03 
 
 
379 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.13 
 
 
375 aa  262  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.71 
 
 
385 aa  262  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.44 
 
 
375 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1568  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.03 
 
 
379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3241  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.03 
 
 
379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2596  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.03 
 
 
383 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1343  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.03 
 
 
379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.44 
 
 
375 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2071  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.03 
 
 
379 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.44 
 
 
375 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.6 
 
 
375 aa  259  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.19 
 
 
382 aa  258  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.37 
 
 
375 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.37 
 
 
375 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  42.43 
 
 
377 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.37 
 
 
375 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>