64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4849 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4849  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  100 
 
 
406 aa  799    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7073  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  63.68 
 
 
391 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5271  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  59.11 
 
 
397 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2143  PTS systemmannitol-specific transporter subunit IIC  59.42 
 
 
490 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678571  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4224  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  56.36 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110658  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1219  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  54.69 
 
 
660 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0220  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.8 
 
 
486 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0268  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  55.62 
 
 
481 aa  388  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5589  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  57.37 
 
 
658 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4165  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.49 
 
 
635 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4447  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.03 
 
 
635 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001632  phosphotransferase system mannitol-specific  52.19 
 
 
650 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0196  PTS system, mannitol-specific IIABC component  51.59 
 
 
649 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3789  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52 
 
 
676 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00834  PTS system, mannitol-specific II ABC component  52.19 
 
 
650 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03454  fused mannitol-specific PTS enzymes: IIA components/IIB components/IIC components  51.17 
 
 
637 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4098  PTS system, mannitol-specific IIABC component  51.17 
 
 
637 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1525  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  53.57 
 
 
356 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.003101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0113  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  51.17 
 
 
637 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4016  PTS system, mannitol-specific IIABC component  51.17 
 
 
637 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.659103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4969  PTS system, mannitol-specific IIABC component  51.17 
 
 
637 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.873696  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03405  hypothetical protein  51.17 
 
 
637 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3806  PTS system, mannitol-specific IIABC component  51.17 
 
 
637 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0107  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  51.17 
 
 
637 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3834  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  50 
 
 
478 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.826504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0052  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  53.28 
 
 
635 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3932  PTS system, mannitol-specific IIABC component  50.91 
 
 
637 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.754882 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2188  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  46.63 
 
 
512 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3780  PTS system mannitol-specific transporter subunit IIABC  53.5 
 
 
643 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2226  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  46.63 
 
 
512 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0072  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  52.99 
 
 
639 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337525  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0026  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  53.5 
 
 
643 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1252  mannitol-specific IIABC component, PTS system  53.43 
 
 
625 aa  365  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4128  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  53.5 
 
 
643 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4004  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.85 
 
 
657 aa  364  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.852778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0985  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  50.13 
 
 
469 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.150194 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0088  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  50.13 
 
 
628 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15272  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3885  pts system mannitol-specific eiicba component  53.89 
 
 
638 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.816196  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2813  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  51.1 
 
 
650 aa  359  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4070  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  52.42 
 
 
638 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.293886  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3901  pts system mannitol-specific eiicba component  52.42 
 
 
638 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4008  PTS system mannitol-specific eiicba component  52.42 
 
 
638 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.32191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3963  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  52.42 
 
 
638 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303673  normal  0.484856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02763  predicted fused mannitol-specific PTS enzymes: IIB component/IIC component  49.48 
 
 
462 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0761  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  49.48 
 
 
462 aa  359  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0778  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  49.48 
 
 
462 aa  359  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0229075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3365  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  49.48 
 
 
462 aa  359  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02726  hypothetical protein  49.48 
 
 
462 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3267  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  49.48 
 
 
462 aa  359  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4234  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  49.48 
 
 
462 aa  359  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0136  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  51.89 
 
 
636 aa  358  9e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4768  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  51.07 
 
 
508 aa  358  9e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0054  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  51.21 
 
 
512 aa  354  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3253  pts system mannitol-specific eiicba component  50.26 
 
 
459 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3320  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  50.26 
 
 
459 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3164  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  47.13 
 
 
668 aa  344  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1845  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  48.31 
 
 
467 aa  334  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07060  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  48.48 
 
 
687 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0027  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  47.11 
 
 
607 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.03795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3090  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component, truncation  48.78 
 
 
407 aa  295  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001413  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIBC subunit  54.29 
 
 
420 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0659  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  49.31 
 
 
436 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0028  PTS system, mannitol-specific IIBC component, putative  38.26 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0458  PTS system, mannitol-specific IIBC component  32.69 
 
 
525 aa  209  6e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.646775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>