More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3279 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03649  dihydroxy-acid dehydratase  78.16 
 
 		 616 aa  1001    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000570599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4205  dihydroxy-acid dehydratase  78.32 
 
 		 616 aa  1003    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00333285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0348  dihydroxy-acid dehydratase  86.04 
 
 		 615 aa  1093    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0485  dihydroxy-acid dehydratase  75.08 
 
 		 616 aa  964    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.543148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5128  dihydroxy-acid dehydratase  73.83 
 
 		 613 aa  936    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7305  dihydroxy-acid dehydratase  67.63 
 
 		 617 aa  795    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4231  dihydroxy-acid dehydratase  78.16 
 
 		 616 aa  1001    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4846  dihydroxy-acid dehydratase  76.21 
 
 		 620 aa  985    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0807241  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4452  dihydroxy-acid dehydratase  72.76 
 
 		 619 aa  921    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.941603 
 
 
-
 
NC_004310  BR0099  dihydroxy-acid dehydratase  73.45 
 
 		 611 aa  880    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0324836  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4345  dihydroxy-acid dehydratase  89.16 
 
 		 619 aa  1121    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5057  dihydroxy-acid dehydratase  73.46 
 
 		 615 aa  932    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0336  dihydroxy-acid dehydratase  73.83 
 
 		 613 aa  933    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0445  dihydroxy-acid dehydratase  84.76 
 
 		 616 aa  1065    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2848  dihydroxy-acid dehydratase  72.31 
 
 		 609 aa  876    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.36735  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0469  dihydroxy-acid dehydratase  72.98 
 
 		 615 aa  927    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1304  dihydroxy-acid dehydratase  70.88 
 
 		 628 aa  899    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0302  dihydroxy-acid dehydratase  73.74 
 
 		 618 aa  945    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000297284  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2209  dihydroxyacid dehydratase  66.13 
 
 		 625 aa  803    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3925  dihydroxy-acid dehydratase  72.92 
 
 		 612 aa  899    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2432  dihydroxy-acid dehydratase  72.28 
 
 		 619 aa  914    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3037  dihydroxy-acid dehydratase  71.31 
 
 		 618 aa  877    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  74.88 
 
 		 925 aa  934    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0213  dihydroxy-acid dehydratase  72.31 
 
 		 614 aa  879    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.450339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4029  dihydroxy-acid dehydratase  87.8 
 
 		 624 aa  1115    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2001  dihydroxy-acid dehydratase  73.54 
 
 		 617 aa  928    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5358  dihydroxy-acid dehydratase  73.34 
 
 		 613 aa  936    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3074  dihydroxy-acid dehydratase  73.08 
 
 		 612 aa  901    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.611367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2723  dihydroxy-acid dehydratase  74.27 
 
 		 612 aa  922    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1899  dihydroxy-acid dehydratase  71.79 
 
 		 619 aa  915    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18498  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5178  dihydroxy-acid dehydratase  73.99 
 
 		 613 aa  937    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3988  dihydroxy-acid dehydratase  78.16 
 
 		 616 aa  1001    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4126  dihydroxy-acid dehydratase  87.8 
 
 		 624 aa  1116    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1121  dihydroxy-acid dehydratase  68.66 
 
 		 615 aa  845    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0097  dihydroxy-acid dehydratase  73.62 
 
 		 613 aa  882    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4757  dihydroxy-acid dehydratase  77.51 
 
 		 616 aa  986    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0890902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0599  dihydroxy-acid dehydratase  72.49 
 
 		 617 aa  909    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0151535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  78.32 
 
 		 616 aa  1004    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2756  dihydroxy-acid dehydratase  73.24 
 
 		 646 aa  917    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5171  dihydroxy-acid dehydratase  66.67 
 
 		 613 aa  775    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0626  dihydroxy-acid dehydratase  74.96 
 
 		 619 aa  931    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546913  normal  0.890987 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1382  dihydroxy-acid dehydratase  71.61 
 
 		 634 aa  915    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.469767  hitchhiker  0.0000362711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1786  dihydroxyacid dehydratase  72.98 
 
 		 625 aa  889    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3737  dihydroxy-acid dehydratase  72.82 
 
 		 614 aa  910    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4162  dihydroxy-acid dehydratase  84.93 
 
 		 616 aa  1065    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4515  dihydroxy-acid dehydratase  69.57 
 
 		 617 aa  834    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4066  dihydroxy-acid dehydratase  72.33 
 
 		 619 aa  910    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1784  dihydroxy-acid dehydratase  73.46 
 
 		 615 aa  909    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1046  dihydroxy-acid dehydratase  70.99 
 
 		 617 aa  889    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0358  dihydroxy-acid dehydratase  72.49 
 
 		 614 aa  913    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4321  dihydroxy-acid dehydratase  72.27 
 
 		 612 aa  885    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.169432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0340  dihydroxy-acid dehydratase  74.88 
 
 		 616 aa  950    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2491  dihydroxy-acid dehydratase  78.32 
 
 		 613 aa  994    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2661  dihydroxy-acid dehydratase  73.23 
 
 		 620 aa  908    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3412  dihydroxy-acid dehydratase  86.43 
 
 		 619 aa  1073    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4057  dihydroxy-acid dehydratase  75.08 
 
 		 616 aa  964    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3804  dihydroxy-acid dehydratase  72.65 
 
 		 619 aa  915    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0169  dihydroxy-acid dehydratase  73.08 
 
 		 613 aa  874    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1074  dihydroxy-acid dehydratase  69.98 
 
 		 636 aa  898    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.413782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4585  dihydroxy-acid dehydratase  72.58 
 
 		 620 aa  902    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0446  dihydroxy-acid dehydratase  75.12 
 
 		 612 aa  943    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2486  dihydroxy-acid dehydratase  70.08 
 
 		 614 aa  882    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274808  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1189  dihydroxy-acid dehydratase  73.83 
 
 		 619 aa  929    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4231  dihydroxy-acid dehydratase  72.92 
 
 		 619 aa  924    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4250  dihydroxy-acid dehydratase  75.04 
 
 		 615 aa  945    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0971242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2666  dihydroxy-acid dehydratase  75.24 
 
 		 611 aa  915    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0342  dihydroxy-acid dehydratase  75.81 
 
 		 611 aa  957    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0292  dihydroxy-acid dehydratase  87.68 
 
 		 616 aa  1115    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0364  dihydroxy-acid dehydratase  89.48 
 
 		 619 aa  1127    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3662  dihydroxy-acid dehydratase  89.32 
 
 		 619 aa  1126    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0418  dihydroxyacid dehydratase  74.31 
 
 		 617 aa  916    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0213625  decreased coverage  0.00250401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5433  dihydroxyacid dehydratase  73.45 
 
 		 613 aa  897    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535881  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0424  dihydroxy-acid dehydratase  85.78 
 
 		 619 aa  1050    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4007  dihydroxy-acid dehydratase  87.96 
 
 		 624 aa  1116    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3546  dihydroxy-acid dehydratase  72.44 
 
 		 619 aa  915    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04630  dihydroxy-acid dehydratase  74.96 
 
 		 612 aa  942    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  78.48 
 
 		 599 aa  984    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0070  dihydroxy-acid dehydratase  73.42 
 
 		 617 aa  904    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0157  dihydroxy-acid dehydratase  75.24 
 
 		 616 aa  966    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4135  dihydroxy-acid dehydratase  72.92 
 
 		 619 aa  924    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0713209  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4656  dihydroxy-acid dehydratase  72.17 
 
 		 617 aa  903    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1909  dihydroxy-acid dehydratase  67.63 
 
 		 619 aa  801    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1838  dihydroxyacid dehydratase  67.53 
 
 		 621 aa  860    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0358  dihydroxy-acid dehydratase  89.64 
 
 		 619 aa  1128    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4282  dihydroxy-acid dehydratase  78.16 
 
 		 616 aa  1002    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5002  dihydroxy-acid dehydratase  73.67 
 
 		 613 aa  934    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.138711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3418  dihydroxy-acid dehydratase  66.88 
 
 		 620 aa  813    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2933  dihydroxy-acid dehydratase  73.08 
 
 		 612 aa  899    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3279  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 618 aa  1258    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3801  dihydroxy-acid dehydratase  73.08 
 
 		 612 aa  901    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.120257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0346  dihydroxy-acid dehydratase  75.36 
 
 		 612 aa  969    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1161  dihydroxy-acid dehydratase  66.94 
 
 		 613 aa  772    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2423  dihydroxy-acid dehydratase  74.27 
 
 		 611 aa  918    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.421855  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0112  dihydroxy-acid dehydratase  74.18 
 
 		 611 aa  901    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1506  dihydroxy-acid dehydratase  72.92 
 
 		 619 aa  921    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4012  dihydroxy-acid dehydratase  77.83 
 
 		 616 aa  1003    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1072  dihydroxy-acid dehydratase  71.47 
 
 		 618 aa  910    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2675  dihydroxy-acid dehydratase  73.62 
 
 		 611 aa  878    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.272323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1231  dihydroxy-acid dehydratase  67.8 
 
 		 638 aa  840    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00143562  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3612  dihydroxy-acid dehydratase  89 
 
 		 619 aa  1122    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>