16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2460 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2460  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1146  hypothetical protein  80.77 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1160  hypothetical protein  64.62 
 
 		 68 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00416619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1241  hypothetical protein  64.18 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2764  hypothetical protein  76.92 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0224355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1319  hypothetical protein  63.64 
 
 		 68 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1310  hypothetical protein  63.64 
 
 		 68 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1346  hypothetical protein  63.64 
 
 		 68 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3040  hypothetical protein  63.64 
 
 		 68 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.975749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1252  hypothetical protein  61.9 
 
 		 71 aa  83.6  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.745034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1487  hypothetical protein  73.08 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1354  hypothetical protein  61.97 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2940  hypothetical protein  56 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2842  hypothetical protein  63.49 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2455  hypothetical protein  48.39 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2284  hypothetical protein  48.98 
 
 		 112 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.115994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>