More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1103 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1103  signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
478 aa  966    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  40.16 
 
 
463 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  39.68 
 
 
467 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  39.68 
 
 
467 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.68 
 
 
467 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.68 
 
 
467 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  39.68 
 
 
467 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.2 
 
 
457 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.27 
 
 
467 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.27 
 
 
467 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.27 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  38.12 
 
 
482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.87 
 
 
467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
488 aa  153  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  38.3 
 
 
471 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  38.46 
 
 
482 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.15 
 
 
455 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.06 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.06 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.06 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.11 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.06 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.55 
 
 
461 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.06 
 
 
467 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.55 
 
 
461 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.55 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.86 
 
 
460 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.5 
 
 
467 aa  147  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
493 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  35.74 
 
 
455 aa  144  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
468 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  38.94 
 
 
518 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
518 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  38.37 
 
 
465 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
516 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  39.15 
 
 
512 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
483 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1105  signal transduction histidine kinase-like protein  34.38 
 
 
1141 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.68 
 
 
453 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  31.84 
 
 
464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
507 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  37.6 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  34.56 
 
 
514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  36.18 
 
 
499 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
451 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  35.84 
 
 
457 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  35.84 
 
 
457 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  35.84 
 
 
457 aa  130  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  35.84 
 
 
457 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  35.84 
 
 
457 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
451 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  35.84 
 
 
457 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  35.84 
 
 
457 aa  130  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  35.84 
 
 
457 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  35.84 
 
 
457 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
501 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  34.96 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  39.6 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  34.96 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  34.96 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  34.96 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  34.96 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  36.55 
 
 
529 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  31.39 
 
 
369 aa  126  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
437 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  32.05 
 
 
463 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
408 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.92 
 
 
495 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
367 aa  124  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  33.63 
 
 
457 aa  123  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
364 aa  123  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
483 aa  123  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
463 aa  123  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  33.93 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  34.8 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  28.25 
 
 
310 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  32.03 
 
 
442 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.59 
 
 
433 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  32.03 
 
 
442 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  32.03 
 
 
442 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  32.03 
 
 
442 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
596 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
425 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  32.03 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
464 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
379 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  34.35 
 
 
456 aa  120  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
379 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  31.64 
 
 
442 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  32.55 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  27.8 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>