65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0678 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0678  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  255  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0819  hypothetical protein  80.65 
 
 
124 aa  215  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0950  hypothetical protein  79.84 
 
 
124 aa  213  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0848  hypothetical protein  79.84 
 
 
124 aa  213  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0765  hypothetical protein  78.23 
 
 
124 aa  208  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3513  protein of unknown function DUF1696  79.03 
 
 
124 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.10394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0735  hypothetical protein  79.03 
 
 
124 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3704  hypothetical protein  79.03 
 
 
124 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3581  hypothetical protein  77.42 
 
 
124 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0829  hypothetical protein  77.42 
 
 
124 aa  204  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3137  hypothetical protein  77.42 
 
 
124 aa  204  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3796  hypothetical protein  77.42 
 
 
124 aa  203  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0801  hypothetical protein  76.61 
 
 
124 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3967  hypothetical protein  62.3 
 
 
124 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2968  protein of unknown function DUF1696  52.89 
 
 
125 aa  153  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000823184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1530  hypothetical protein  54.84 
 
 
125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1246  hypothetical protein  55.2 
 
 
125 aa  150  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000430904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17100  Protein of unknown function (DUF1696)  52.42 
 
 
125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.319625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4419  protein of unknown function DUF1696  53.33 
 
 
124 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00781  hypothetical protein  56.67 
 
 
124 aa  144  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.484953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4366  hypothetical protein  51.64 
 
 
125 aa  144  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1850  hypothetical protein  50.41 
 
 
125 aa  142  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.468949  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0773  hypothetical protein  56 
 
 
126 aa  141  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.39143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2592  hypothetical protein  49.59 
 
 
125 aa  140  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0276501 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2717  hypothetical protein  48.78 
 
 
125 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.518369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2764  hypothetical protein  49.59 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.527603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2474  hypothetical protein  49.59 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000514005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2439  hypothetical protein  49.59 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2698  hypothetical protein  49.59 
 
 
125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.929061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2513  hypothetical protein  49.59 
 
 
125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2712  hypothetical protein  49.59 
 
 
125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000335189 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2445  hypothetical protein  48.78 
 
 
125 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00267859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1053  hypothetical protein  57.8 
 
 
125 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0224  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  137  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2100  protein of unknown function DUF1696  47.62 
 
 
126 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320981  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3944  hypothetical protein  52.25 
 
 
124 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.195565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4312  protein of unknown function DUF1696  51.35 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2961  hypothetical protein  49.54 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5218  protein of unknown function DUF1696  50.98 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454954  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1528  hypothetical protein  52.8 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00537923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0972  hypothetical protein  39.29 
 
 
121 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1562  hypothetical protein  35.48 
 
 
127 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520786  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11460  Protein of unknown function (DUF1696)  41.46 
 
 
125 aa  95.1  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1634  protein of unknown function DUF1696  43.93 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2096  protein of unknown function DUF1696  44.86 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00367109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0450  protein of unknown function DUF1696  35.83 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00191291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1018  hypothetical protein  44.04 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001163  GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1  35.71 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1632  protein of unknown function DUF1696  41.35 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0378038 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2411  hypothetical protein  59.02 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.342791  normal  0.0159601 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04942  hypothetical protein  42.17 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3190  protein of unknown function DUF1696  38.4 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000611457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26210  Protein of unknown function (DUF1696)  41.35 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0252332  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2235  protein of unknown function DUF1696  37.62 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0790271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4373  hypothetical protein  32.18 
 
 
204 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000851345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4710  hypothetical protein  32.18 
 
 
204 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4564  hypothetical protein  32.18 
 
 
204 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4220  hypothetical protein  32.18 
 
 
204 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4322  hypothetical protein  32.18 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000820801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4595  hypothetical protein  32.18 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000933479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4570  hypothetical protein  31.03 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.103016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4614  hypothetical protein  31.03 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4210  hypothetical protein  31.03 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0414  protein of unknown function DUF1696  30.69 
 
 
204 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0640  hypothetical protein  31.03 
 
 
204 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00127243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>