19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0053 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00250701  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0038  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000159242  hitchhiker  0.000533076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0036  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000153863  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0041  hypothetical protein  42.22 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0044  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000193062  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0041  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00282046  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0036  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0051156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0040  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000215973  unclonable  0.0000087148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0040  protein of unknown function DUF1488  41.11 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00230269  unclonable  0.00000000000350952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3726  hypothetical protein  39.53 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00243512  hitchhiker  0.00809749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0041  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000318858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0035  hypothetical protein  39.53 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000637046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0033  hypothetical protein  37.78 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000298861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0035  hypothetical protein  41.86 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0048  hypothetical protein  38.37 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00169454  normal  0.150477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0044  hypothetical protein  35.96 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000282672  normal  0.843809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2462  hypothetical protein  37.21 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000144431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00381  hypothetical protein  41.86 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002068  hypothetical protein  42.35 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000363608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>