More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2089 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2089  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 559 aa  1107    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268373  normal  0.985504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 555 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 763 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 763 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  33.46 
 
 		 1301 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0114339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 1255 aa  117  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2460  histidine kinase  36.65 
 
 		 606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  34.21 
 
 		 683 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 763 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1015 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  31.11 
 
 		 1026 aa  110  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.38 
 
 		 639 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1411  diguanylate cyclase  32.53 
 
 		 656 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1835  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.35 
 
 		 654 aa  107  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0773497  normal  0.315507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  30.91 
 
 		 847 aa  107  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 583 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  32.99 
 
 		 583 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 725 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 772 aa  104  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  29.82 
 
 		 842 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  26.65 
 
 		 908 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 583 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.46 
 
 		 1054 aa  100  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 719 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 347 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  30.57 
 
 		 692 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 372 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 364 aa  97.8  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.59 
 
 		 1168 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 602 aa  96.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 763 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 571 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 488 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 965 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  32.12 
 
 		 334 aa  93.2  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  30.6 
 
 		 822 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 384 aa  93.2  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 867 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 717 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 336 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 334 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 559 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 759 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 579 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 887 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.92 
 
 		 1160 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 929 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1483  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 391 aa  91.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 717 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 639 aa  91.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 488 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  29.3 
 
 		 717 aa  90.9  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.58 
 
 		 1063 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  29.44 
 
 		 844 aa  90.5  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  30.09 
 
 		 993 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 488 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  29.15 
 
 		 1036 aa  90.5  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 1124 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 850 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 488 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 575 aa  90.1  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 713 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 869 aa  90.1  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 840 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  29.9 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 662 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 577 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 717 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 717 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 717 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 500 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 635 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 1132 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  33.51 
 
 		 1132 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.63 
 
 		 1061 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 1111 aa  87  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  29.07 
 
 		 1027 aa  87.4  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 717 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 258 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 572 aa  87  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 601 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.12 
 
 		 1190 aa  86.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 633 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  30.53 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  32.87 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  30.37 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  33.53 
 
 		 655 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 655 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 717 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 869 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>