79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1941 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1941  succinylarginine dihydrolase  100 
 
 		 415 aa  835    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0882  succinylarginine dihydrolase  68.91 
 
 		 421 aa  531  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.465376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0527  succinylarginine dihydrolase  54.7 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2225  succinylarginine dihydrolase  45.39 
 
 		 445 aa  345  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1534  succinylarginine dihydrolase  45.66 
 
 		 445 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1321  succinylarginine dihydrolase  44.21 
 
 		 444 aa  339  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0233544  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2329  succinylarginine dihydrolase  44.91 
 
 		 444 aa  339  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.217972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2706  succinylarginine dihydrolase  44.72 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2842  succinylarginine dihydrolase  45.62 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355282  hitchhiker  0.000000291277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2357  succinylarginine dihydrolase  45.5 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1594  succinylarginine dihydrolase  46.35 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539722  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1728  succinylarginine dihydrolase  44.27 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2479  succinylarginine dihydrolase  43.98 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913037  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1659  succinylarginine dihydrolase  44.5 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.149262  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1802  succinylarginine dihydrolase  44.7 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.303487  hitchhiker  0.0000138557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1584  succinylarginine dihydrolase  44.27 
 
 		 444 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2907  succinylarginine dihydrolase  44.06 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254862  normal  0.617439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1854  succinylarginine dihydrolase  43.98 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000137714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2497  succinylarginine dihydrolase  43.98 
 
 		 444 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02354  succinylarginine dihydrolase  43.65 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0061994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2804  succinylarginine dihydrolase  47.22 
 
 		 447 aa  332  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2490  succinylarginine dihydrolase  43.52 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2610  succinylarginine dihydrolase  43.52 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0460868  hitchhiker  0.00355964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2251  succinylarginine dihydrolase  43.6 
 
 		 444 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1855  succinylarginine dihydrolase  48.39 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.367441  normal  0.80763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1779  succinylarginine dihydrolase  44.85 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3671  succinylarginine dihydrolase  41.97 
 
 		 448 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0626  succinylarginine dihydrolase  48.94 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00494853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1836  succinylarginine dihydrolase  42.89 
 
 		 448 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1065  succinylarginine dihydrolase  43.02 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1065  succinylarginine dihydrolase  43.02 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4616  succinylarginine dihydrolase  43.15 
 
 		 448 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2841  succinylarginine dihydrolase  42.66 
 
 		 446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3766  succinylarginine dihydrolase  42.01 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283643  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52660  succinylarginine dihydrolase  42.24 
 
 		 448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3561  succinylarginine dihydrolase  42.2 
 
 		 448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0211379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0073  succinylarginine dihydrolase  42.59 
 
 		 444 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2919  succinylarginine dihydrolase  44.29 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3982  succinylarginine dihydrolase  42.47 
 
 		 449 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2421  succinylarginine dihydrolase  44.62 
 
 		 446 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2870  succinylarginine dihydrolase  44.62 
 
 		 446 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4281  succinylarginine dihydrolase  43.45 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2842  succinylarginine dihydrolase  44.62 
 
 		 446 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1732  succinylarginine dihydrolase  44.62 
 
 		 446 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.728912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0595  succinylarginine dihydrolase  44.62 
 
 		 446 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2781  succinylarginine dihydrolase  44.62 
 
 		 446 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1562  succinylarginine dihydrolase  43.61 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4477  succinylarginine dihydrolase  41.78 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.146428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1446  succinylarginine dihydrolase  42.66 
 
 		 447 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2463  succinylarginine dihydrolase  42.89 
 
 		 447 aa  316  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.849491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2204  succinylarginine dihydrolase  45.96 
 
 		 447 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.5143  normal  0.200224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2120  succinylarginine dihydrolase  42.79 
 
 		 446 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.949409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1783  succinylarginine dihydrolase  43.15 
 
 		 446 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1991  succinylarginine dihydrolase  42.89 
 
 		 453 aa  315  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1887  succinylarginine dihydrolase  42.89 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0206768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01714  succinylarginine dihydrolase  42.66 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01702  hypothetical protein  42.66 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1897  succinylarginine dihydrolase  42.66 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1699  succinylarginine dihydrolase  44.52 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2723  succinylarginine dihydrolase  44.39 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4295  succinylarginine dihydrolase  42.11 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569596  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1438  succinylarginine dihydrolase  41.78 
 
 		 449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0705  succinylarginine dihydrolase  42.11 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1184  succinylarginine dihydrolase  42.11 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316114  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0487  succinylarginine dihydrolase  44.6 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2517  succinylarginine dihydrolase  44.01 
 
 		 447 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.658735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1161  succinylarginine dihydrolase  41.88 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0804902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1967  succinylarginine dihydrolase  42.66 
 
 		 447 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2226  succinylarginine dihydrolase  44.01 
 
 		 447 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1828  succinylarginine dihydrolase  42.19 
 
 		 447 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1433  succinylarginine dihydrolase  43.12 
 
 		 447 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1401  succinylarginine dihydrolase  43.12 
 
 		 447 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587954  normal  0.224315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3315  succinylarginine dihydrolase  43.25 
 
 		 446 aa  308  9e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1418  succinylarginine dihydrolase  43.12 
 
 		 447 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1867  succinylarginine dihydrolase  43.12 
 
 		 447 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2040  succinylarginine dihydrolase  42.89 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2118  succinylarginine dihydrolase  43.78 
 
 		 447 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1673  succinylarginine dihydrolase  40.83 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1667  succinylarginine dihydrolase  40.83 
 
 		 448 aa  305  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>