13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0996 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0996  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  168  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2869  hypothetical protein  96.39 
 
 
85 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1816  hypothetical protein  95.18 
 
 
93 aa  160  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0040301  normal  0.186382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2757  hypothetical protein  95.18 
 
 
88 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185764  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3126  hypothetical protein  95.18 
 
 
85 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3065  hypothetical protein  93.98 
 
 
85 aa  158  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277532  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3100  hypothetical protein  95.18 
 
 
83 aa  157  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.466356  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1665  hypothetical protein  93.98 
 
 
85 aa  157  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.704705  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0665  hypothetical protein  92.77 
 
 
92 aa  156  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00921375  normal  0.286468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1824  hypothetical protein  92.77 
 
 
83 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.725883  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1452  hypothetical protein  93.98 
 
 
83 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1937  hypothetical protein  92.77 
 
 
85 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1724  hypothetical protein  92.77 
 
 
104 aa  154  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>