43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0096 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0096    100 
 
 		 985 bp  1953    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.511395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  89.26 
 
 		 540 bp  569  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  86.34 
 
 		 513 bp  145  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  79.59 
 
 		 444 bp  125  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  85.21 
 
 		 516 bp  115  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  78.88 
 
 		 507 bp  105  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  90.91 
 
 		 510 bp  97.6  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  82.47 
 
 		 534 bp  91.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  89.61 
 
 		 510 bp  89.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  81.11 
 
 		 510 bp  87.7  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  81.11 
 
 		 510 bp  87.7  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  84.82 
 
 		 444 bp  87.7  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  87.36 
 
 		 537 bp  85.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  78.11 
 
 		 507 bp  83.8  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  81.53 
 
 		 519 bp  81.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  87.5 
 
 		 516 bp  79.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  87.5 
 
 		 516 bp  79.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  87.5 
 
 		 516 bp  79.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  80.84 
 
 		 507 bp  77.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  82.79 
 
 		 540 bp  75.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  81.51 
 
 		 510 bp  75.8  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  81.51 
 
 		 444 bp  75.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  82.88 
 
 		 447 bp  69.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  95.24 
 
 		 522 bp  67.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  82.73 
 
 		 450 bp  67.9  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  83.51 
 
 		 519 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  80.54 
 
 		 519 bp  65.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  84.09 
 
 		 609 bp  63.9  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  81.3 
 
 		 450 bp  61.9  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  94.87 
 
 		 507 bp  61.9  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  80 
 
 		 549 bp  61.9  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  82.08 
 
 		 447 bp  60  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  90 
 
 		 507 bp  60  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  80.95 
 
 		 510 bp  60  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  83.15 
 
 		 540 bp  58  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 504 bp  54  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  81.08 
 
 		 441 bp  54  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  81.08 
 
 		 441 bp  54  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  94.29 
 
 		 540 bp  54  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  92.11 
 
 		 504 bp  52  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  91.89 
 
 		 480 bp  50.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  96.43 
 
 		 621 bp  48.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  79.84 
 
 		 462 bp  48.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>