More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0358 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0358  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 683 aa  1375    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000301729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  45.57 
 
 		 693 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  40.73 
 
 		 694 aa  398  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  40.21 
 
 		 859 aa  395  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  42.47 
 
 		 700 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  42.27 
 
 		 700 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  41.57 
 
 		 702 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  41.23 
 
 		 894 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  43.29 
 
 		 695 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  41.84 
 
 		 710 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  40.43 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  41.32 
 
 		 751 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  42.3 
 
 		 693 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  40.4 
 
 		 694 aa  389  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  42.14 
 
 		 689 aa  382  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  39.18 
 
 		 711 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  40.23 
 
 		 691 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  39.86 
 
 		 831 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  41.54 
 
 		 841 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  39.86 
 
 		 831 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  37.81 
 
 		 836 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  41.68 
 
 		 694 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  40.96 
 
 		 706 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  39.9 
 
 		 743 aa  379  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  39.72 
 
 		 831 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  40.68 
 
 		 695 aa  380  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  40.18 
 
 		 696 aa  382  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  40.93 
 
 		 813 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  40.68 
 
 		 700 aa  379  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  39.18 
 
 		 697 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  39.93 
 
 		 711 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  39.3 
 
 		 767 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  37.96 
 
 		 758 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  40.82 
 
 		 825 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  40.86 
 
 		 700 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  41.04 
 
 		 700 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  40.28 
 
 		 697 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  40.18 
 
 		 703 aa  372  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  40.7 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  40.18 
 
 		 703 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  38.23 
 
 		 702 aa  372  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  38.73 
 
 		 760 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  40.82 
 
 		 747 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  40.76 
 
 		 780 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  41.11 
 
 		 839 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  39.08 
 
 		 894 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  40.32 
 
 		 703 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  40.57 
 
 		 704 aa  368  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  39.37 
 
 		 758 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  39.56 
 
 		 835 aa  365  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  37.91 
 
 		 853 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  38.06 
 
 		 797 aa  364  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  38.66 
 
 		 684 aa  363  4e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  40.14 
 
 		 865 aa  362  1e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  37.88 
 
 		 877 aa  361  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  40.5 
 
 		 690 aa  361  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  39.32 
 
 		 857 aa  360  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  39.45 
 
 		 768 aa  360  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  39.55 
 
 		 789 aa  360  6e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  39.31 
 
 		 691 aa  360  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  39.45 
 
 		 841 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  40 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  39.5 
 
 		 686 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  39.44 
 
 		 836 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  38.27 
 
 		 849 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  40 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  39.21 
 
 		 886 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  39.39 
 
 		 792 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  38.93 
 
 		 746 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  39.97 
 
 		 758 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  38.75 
 
 		 872 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  37.41 
 
 		 884 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  40.14 
 
 		 748 aa  356  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  39.03 
 
 		 879 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  37.41 
 
 		 914 aa  355  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  39.65 
 
 		 823 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  38.61 
 
 		 780 aa  355  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  39.54 
 
 		 756 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  38.81 
 
 		 779 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  38.55 
 
 		 877 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  35.49 
 
 		 904 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  37.24 
 
 		 834 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  37.89 
 
 		 866 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  37.76 
 
 		 708 aa  354  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  39.82 
 
 		 854 aa  353  5e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  39.04 
 
 		 715 aa  353  5e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  36.89 
 
 		 904 aa  353  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  37.59 
 
 		 884 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  37.91 
 
 		 868 aa  352  8.999999999999999e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  38.38 
 
 		 877 aa  352  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  39.13 
 
 		 783 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  38.47 
 
 		 779 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  40.34 
 
 		 784 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  38.1 
 
 		 721 aa  351  2e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  38.62 
 
 		 689 aa  351  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  38.11 
 
 		 869 aa  352  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  38.77 
 
 		 909 aa  351  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  38.05 
 
 		 867 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  38.34 
 
 		 867 aa  351  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  37.44 
 
 		 865 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>