More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0303 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0303  NusG antitermination factor  100 
 
 		 265 aa  530  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000020407  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0253  NusG antitermination factor  55.56 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  45.65 
 
 		 185 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  46.04 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  49.23 
 
 		 176 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  44.6 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  45.38 
 
 		 185 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  44.6 
 
 		 176 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  44.03 
 
 		 174 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  43.48 
 
 		 176 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  44.6 
 
 		 176 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  44.6 
 
 		 176 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  42.75 
 
 		 176 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  45.04 
 
 		 194 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  45.04 
 
 		 194 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  45.8 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  48.33 
 
 		 177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  42.45 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  48 
 
 		 194 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  47.69 
 
 		 177 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  50.39 
 
 		 175 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  49.19 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  42.75 
 
 		 176 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  46.15 
 
 		 176 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  48.84 
 
 		 175 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  48.84 
 
 		 175 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  42.45 
 
 		 176 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  49.23 
 
 		 187 aa  118  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  50.83 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  42.86 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  48 
 
 		 188 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  48.12 
 
 		 190 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  43.17 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  43.17 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  47.2 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  45.74 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  47.2 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  47.2 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  44.7 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  43.17 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  43.85 
 
 		 176 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  45.38 
 
 		 180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  47.2 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  44.29 
 
 		 177 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  47.2 
 
 		 185 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  47.2 
 
 		 185 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  47.2 
 
 		 185 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  47.2 
 
 		 185 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  47.15 
 
 		 193 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  47.15 
 
 		 193 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  45.38 
 
 		 177 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  41.3 
 
 		 176 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  46.4 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  46.77 
 
 		 194 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  46.4 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  46.4 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  46.4 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  42.66 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  46.4 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  46.4 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  46.4 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  46.77 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  47.86 
 
 		 189 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  43.08 
 
 		 176 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  48.06 
 
 		 175 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  43.26 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  47.29 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  46.72 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  43.9 
 
 		 175 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  49.28 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  47.73 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  49.17 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  43.57 
 
 		 177 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  42.75 
 
 		 176 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  45.6 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  45.97 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  47.29 
 
 		 175 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  43.1 
 
 		 175 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  48.36 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  46.34 
 
 		 185 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  46.34 
 
 		 185 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  46.34 
 
 		 185 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  49.17 
 
 		 203 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  45.97 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  48.36 
 
 		 177 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  42.03 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 177 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 177 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 177 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  42.03 
 
 		 175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  48.55 
 
 		 179 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  43.1 
 
 		 175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  40.77 
 
 		 176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  46.28 
 
 		 177 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  48.55 
 
 		 179 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  40.74 
 
 		 178 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  42.03 
 
 		 175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 183 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>