36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0096 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0096  ribonuclease BN  100 
 
 		 302 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000052367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  23.29 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  21.96 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0628  ribonuclease BN  25.28 
 
 		 258 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.813262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  24.34 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  23.45 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  20.7 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  20.85 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.1 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  22.22 
 
 		 375 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  22.03 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  22.03 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  22.03 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  22.09 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  22.79 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  21.61 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  20.76 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  21.94 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  20.2 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  22.35 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.83 
 
 		 525 aa  47  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  20.38 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  20.9 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  20.83 
 
 		 359 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  20.34 
 
 		 401 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.83 
 
 		 525 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  20.38 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  20.23 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  22.85 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  20.82 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  20.07 
 
 		 396 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  21.51 
 
 		 392 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  20.89 
 
 		 397 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  20.14 
 
 		 367 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  18.91 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>