73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0094 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0094  ribosomal protein S20  100 
 
 
104 aa  201  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.25858e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1129  ribosomal protein S20  44.44 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  39.33 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  37.18 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  38.67 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  39.74 
 
 
88 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  41.03 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  42.25 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  35.21 
 
 
86 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  34.18 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  42.31 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  34.94 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  40.28 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  43.08 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  40.28 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  38.96 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  43.08 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  40.28 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  37.14 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  37.18 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  38.81 
 
 
91 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  38.81 
 
 
91 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.27 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  37.33 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  33.71 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  43.66 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  39.74 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  35.71 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  37.33 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  34.18 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  39.44 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  38.03 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  30 
 
 
89 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  35.14 
 
 
88 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  31.58 
 
 
92 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  34.72 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  32.18 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  32.18 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  34.67 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  34.57 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  35.71 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  35.71 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  36.49 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  35.71 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4886  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222256  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  34.18 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  37.35 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  36.49 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  34.72 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  32.53 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  36.49 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  35.82 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  40.54 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  38.89 
 
 
86 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  32.95 
 
 
100 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>