25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_t1997 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1997  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1780  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0185  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00655162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149702  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0708592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0026  tRNA-Asn  96.36 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2604  tRNA-Asn  96.36 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0012  tRNA-Asn  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00142633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0013  tRNA-Asn  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0040  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0275291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0012  tRNA-Asn  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0014  tRNA-Asn  87.1 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102189  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0545  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00940655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1796  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3013000000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1802  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000154266 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1563  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0452  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0024  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0049  tRNA-Asn  83.78 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000556498  normal  0.485056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>