More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1293 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1293  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0233393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0308  ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 
298 aa  308  5e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  39.93 
 
 
299 aa  221  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  39.93 
 
 
299 aa  221  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0886  ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00203373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 
300 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 
300 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  37.93 
 
 
300 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
300 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
300 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
300 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  37.93 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.9 
 
 
300 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 
300 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  32.07 
 
 
299 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  36.73 
 
 
300 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  30.03 
 
 
320 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.45 
 
 
308 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.6 
 
 
310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  35.5 
 
 
307 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  30.69 
 
 
305 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  31.82 
 
 
298 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  27.43 
 
 
299 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  35.47 
 
 
302 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  30.8 
 
 
295 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  35.16 
 
 
289 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.41 
 
 
295 aa  149  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  31.14 
 
 
304 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  32.86 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  29.14 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  30.14 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  32.12 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  31.42 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  29.87 
 
 
308 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  35.84 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  31.29 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  36.28 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 
293 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
317 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  29.89 
 
 
300 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  33.73 
 
 
322 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
314 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  35.43 
 
 
284 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
301 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 
306 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  33.02 
 
 
308 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  28.94 
 
 
309 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  30.84 
 
 
355 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  37.28 
 
 
246 aa  142  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 
306 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  32.7 
 
 
308 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  34.26 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  31.83 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  34.78 
 
 
284 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  33.66 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  26.71 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  33.8 
 
 
333 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  34.22 
 
 
305 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  30.97 
 
 
341 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  31.7 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  34.11 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  33.9 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  34.63 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  32.04 
 
 
318 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  28.57 
 
 
326 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  33.79 
 
 
301 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  34.1 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.39 
 
 
311 aa  138  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  33.89 
 
 
256 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  34.29 
 
 
305 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  28.89 
 
 
313 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  30.89 
 
 
315 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  35.85 
 
 
321 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  27.62 
 
 
302 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
585 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.93 
 
 
301 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  29.51 
 
 
310 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  34.53 
 
 
305 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  32.04 
 
 
322 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  29.19 
 
 
302 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.7 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  28.89 
 
 
329 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  35.92 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  36.77 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  30.9 
 
 
314 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  36.36 
 
 
306 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  34.56 
 
 
282 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  32.74 
 
 
323 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 
305 aa  136  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
310 aa  136  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  31.7 
 
 
326 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  35.09 
 
 
304 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.05 
 
 
282 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  32.94 
 
 
593 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  37.55 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>