More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0350 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0350  K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.53262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  53.81 
 
 
223 aa  254  8e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  37.91 
 
 
217 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  38.07 
 
 
217 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  35.24 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  31.8 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  31.8 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  32.38 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  35.24 
 
 
227 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  35.06 
 
 
220 aa  121  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  35.06 
 
 
220 aa  121  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  34.48 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  32.21 
 
 
218 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  31.6 
 
 
218 aa  118  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  33.18 
 
 
217 aa  118  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 
233 aa  118  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  31.8 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  34.25 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  34.44 
 
 
221 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  34.44 
 
 
221 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  34.44 
 
 
221 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  34.44 
 
 
221 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  34.44 
 
 
221 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  34.44 
 
 
221 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  34.44 
 
 
221 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  34.44 
 
 
221 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  34.44 
 
 
221 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  34.44 
 
 
221 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  32.24 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  33.51 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  31.13 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  31.9 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  30.22 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  31.13 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  33.89 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  31.34 
 
 
223 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  35.23 
 
 
218 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  30.66 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  32.22 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  28.84 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  33.03 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  31.39 
 
 
222 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  29.28 
 
 
217 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  32.71 
 
 
225 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  29.77 
 
 
231 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  32.52 
 
 
234 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  31.84 
 
 
222 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  29.25 
 
 
233 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  32.23 
 
 
223 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  30.66 
 
 
220 aa  104  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  28.77 
 
 
231 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  32.4 
 
 
222 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  27.36 
 
 
232 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0807  TrkA-N domain protein  31.64 
 
 
234 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  30.19 
 
 
213 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  32.52 
 
 
234 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  31.05 
 
 
213 aa  100  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  29.3 
 
 
224 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 
220 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  32.04 
 
 
234 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  33.52 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  32.52 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  33.15 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  33.5 
 
 
216 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  32.52 
 
 
234 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  32.52 
 
 
234 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00941  VIC family potassium channel protein  32.52 
 
 
234 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  33 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  28.8 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  33.51 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  29.44 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  26.98 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  33 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  32.58 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  32.58 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  32.02 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  32.69 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  32 
 
 
217 aa  95.5  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  31.46 
 
 
220 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  30.54 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  26.98 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  27.75 
 
 
228 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  27.49 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  27.75 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  28.71 
 
 
222 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  29.17 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  32.61 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  27.8 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  28.23 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  30.34 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  27.75 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  32.07 
 
 
220 aa  89.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2069  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0294  TrkA domain-containing protein  27.91 
 
 
245 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  30 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3603  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>