13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0076 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0076  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0337639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  42.55 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 		 211 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.37 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.22 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0032  putative plasmid partition protein A  37.21 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0137071  normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  37.21 
 
 		 219 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  29.41 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  29.41 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1359  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000528372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3019  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3162  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  27.37 
 
 		 247 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>