15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3276 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3276  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1248  hypothetical protein  83.07 
 
 		 313 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1318  hypothetical protein  83.17 
 
 		 335 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1298  hypothetical protein  83.49 
 
 		 315 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2985  hypothetical protein  72.82 
 
 		 314 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3129  hypothetical protein  72.49 
 
 		 314 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.161074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1392  hypothetical protein  72.49 
 
 		 314 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.829307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2971  hypothetical protein  72.17 
 
 		 314 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0837485  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2633  hypothetical protein  69.62 
 
 		 314 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1150  hypothetical protein  55.63 
 
 		 310 aa  325  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3110  hypothetical protein  53.58 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1572  hypothetical protein  52.73 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1314  hypothetical protein  47.28 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1280  hypothetical protein  44.44 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.483733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2340  hypothetical protein  41.8 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>