31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3140.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3140.1  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  77.98 
 
 		 696 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  76.15 
 
 		 696 aa  168  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  73.73 
 
 		 700 aa  147  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  66.97 
 
 		 657 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  74.11 
 
 		 680 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  59.26 
 
 		 677 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  80 
 
 		 701 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  80 
 
 		 701 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  80 
 
 		 701 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  79.46 
 
 		 698 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  44.44 
 
 		 612 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  44.44 
 
 		 642 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  41.67 
 
 		 687 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  35.23 
 
 		 725 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  38.18 
 
 		 655 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  29.29 
 
 		 639 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  31.91 
 
 		 745 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  33.78 
 
 		 722 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  31.43 
 
 		 822 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  33.68 
 
 		 757 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  32.89 
 
 		 738 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  32.43 
 
 		 720 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  31.71 
 
 		 741 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  32.93 
 
 		 729 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  26.92 
 
 		 639 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  32.08 
 
 		 650 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  33.33 
 
 		 745 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  56.25 
 
 		 764 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  27.96 
 
 		 727 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  32.08 
 
 		 650 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>