292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2503 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2503  queuosine biosynthesis protein QueC  100 
 
 		 238 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2059  queuosine biosynthesis protein QueC  94.2 
 
 		 239 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1854  queuosine biosynthesis protein QueC  89.36 
 
 		 245 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.330643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2115  queuosine biosynthesis protein QueC  92.86 
 
 		 240 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1916  queuosine biosynthesis protein QueC  93.78 
 
 		 239 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2161  queuosine biosynthesis protein QueC  93.24 
 
 		 240 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0464548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4541  queuosine biosynthesis protein QueC  89.27 
 
 		 240 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2255  queuosine biosynthesis protein QueC  89.27 
 
 		 240 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2269  queuosine biosynthesis protein QueC  89.27 
 
 		 240 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00296977  normal  0.263758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2164  queuosine biosynthesis protein QueC  92.89 
 
 		 239 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2015  queuosine biosynthesis protein QueC  82.67 
 
 		 232 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1876  exsB protein  81.86 
 
 		 235 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.96525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1826  ExsB protein  80.44 
 
 		 230 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412081  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2552  exsB protein  79.3 
 
 		 233 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312258  hitchhiker  0.0077162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2349  exsB protein  79.46 
 
 		 227 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00952166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2048  ExsB protein  77.33 
 
 		 232 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.49129  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02384  queuosine biosynthesis protein QueC  76.44 
 
 		 232 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2062  exsB protein  77.58 
 
 		 227 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1965  queuosine biosynthesis protein QueC  76.21 
 
 		 227 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.681821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003399  queuosine Biosynthesis QueC ATPase  75.78 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0980  queuosine biosynthesis protein QueC  73.99 
 
 		 231 aa  361  6e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2870  exsB protein  68.75 
 
 		 231 aa  338  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1055  queuosine biosynthesis protein QueC  69.91 
 
 		 231 aa  338  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.717702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3257  queuosine biosynthesis protein QueC  68.86 
 
 		 231 aa  337  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3227  queuosine biosynthesis protein QueC  68.56 
 
 		 232 aa  335  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3085  queuosine biosynthesis protein QueC  68.56 
 
 		 232 aa  335  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000336836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3046  queuosine biosynthesis protein QueC  68.56 
 
 		 232 aa  335  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3062  exsB protein  67.86 
 
 		 231 aa  332  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0480  queuosine biosynthesis protein QueC  68.14 
 
 		 231 aa  330  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0367  queuosine biosynthesis protein QueC  68.14 
 
 		 231 aa  330  8e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.976295  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0521  queuosine biosynthesis protein QueC  68.14 
 
 		 231 aa  330  8e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0104585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0487  queuosine biosynthesis protein QueC  68.14 
 
 		 231 aa  330  9e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0497  queuosine biosynthesis protein QueC  68.58 
 
 		 231 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0558  queuosine biosynthesis protein QueC  68.58 
 
 		 231 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0495  queuosine biosynthesis protein QueC  68.58 
 
 		 231 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3165  exsB protein  67.7 
 
 		 231 aa  329  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.6328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0504  queuosine biosynthesis protein QueC  68.58 
 
 		 231 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0530  queuosine biosynthesis protein QueC  67.7 
 
 		 231 aa  329  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0911  queuosine biosynthesis protein QueC  67.98 
 
 		 242 aa  328  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0514  queuosine biosynthesis protein QueC  68.14 
 
 		 231 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00396  predicted aluminum resistance protein  67.7 
 
 		 231 aa  328  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3188  queuosine biosynthesis protein QueC  67.7 
 
 		 231 aa  328  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0204492 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00400  hypothetical protein  67.7 
 
 		 231 aa  328  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1102  queuosine biosynthesis protein QueC  68.28 
 
 		 232 aa  327  9e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232921  hitchhiker  0.00000230205 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0262  exsB protein  61.11 
 
 		 238 aa  291  4e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0752  exsB protein  59.45 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0736  exsB protein  59.45 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0373  exsB protein  59.81 
 
 		 223 aa  275  4e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1770  exsB protein  57.4 
 
 		 224 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0894  exsB protein  58.06 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1394  exsB protein  57.6 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.83856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1064  exsB protein  57.27 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.704642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1256  exsB protein  56.68 
 
 		 220 aa  265  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1497  exsB protein  57.14 
 
 		 220 aa  265  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00251456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1458  exsB protein  57.14 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.275784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1230  aluminum resistance protein  57.14 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1232  aluminum resistance protein  57.14 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3949  exsB protein  57.14 
 
 		 220 aa  264  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.431114  normal  0.0627168 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1257  exsB protein  57.14 
 
 		 220 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1359  ExsB family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 220 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1430  exsB protein  57.14 
 
 		 220 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191771 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0869  PP-loop superfamily ATPase  57.08 
 
 		 217 aa  244  6.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000338884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1063  exsB protein  48.03 
 
 		 237 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2795  exsB protein  48.31 
 
 		 244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0152  exsB protein  48.31 
 
 		 244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0355  exsB protein  48.31 
 
 		 244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.311751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0171  exsB protein  48.31 
 
 		 244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2284  exsB protein  48.31 
 
 		 244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2363  exsB protein  48.31 
 
 		 244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0161  ExsB protein  48.31 
 
 		 244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.720442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1260  exsB protein  47.21 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0137  exsB protein  47.26 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.948426  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0736  ExsB  46.5 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2505  ExsB  45.57 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0508398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3119  exsB protein  45.57 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3135  exsB protein  45.57 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3116  exsB protein  45.57 
 
 		 244 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0417269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3057  exsB protein  45.57 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6470  ExsB family protein  44.3 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3174  exsB protein  45.57 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0317  exsB protein  45.19 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2697  exsB protein  49.55 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0272  exsB protein  48.02 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0441813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4407  ExsB  45.26 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1846  ExsB  46.05 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0043  exsB protein  44.68 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0734  ExsB  48.47 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0636  exsB protein  49.17 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170308  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0258  exsB protein  47.6 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1125  exsB protein  46.41 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1874  exsB protein  45.85 
 
 		 249 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3148  exsB protein  45.06 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185944  normal  0.138551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0139  exsB protein  43.35 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1081  exsB protein  46.35 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0596  exsB protein  45.19 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.906918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4986  exsB protein  45.13 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6745  exsB protein  45.29 
 
 		 233 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4006  exsB protein  43.7 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2709  ExsB  44.49 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.492214  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4081  hypothetical protein  43.97 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>