26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2214 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2214    100 
 
 		 1050 bp  2081    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  83.24 
 
 		 1272 bp  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  83.33 
 
 		 1272 bp  694    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  82.48 
 
 		 1272 bp  622  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  80.19 
 
 		 1272 bp  262  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  79.72 
 
 		 1272 bp  238  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  79.56 
 
 		 1272 bp  230  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  79.4 
 
 		 1272 bp  222  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  79.4 
 
 		 1272 bp  222  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213.1  glucose-galactose transporter  100 
 
 		 279 bp  115  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  80.37 
 
 		 1266 bp  93.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  86 
 
 		 1248 bp  87.7  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  82.48 
 
 		 1266 bp  81.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  94.12 
 
 		 1275 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  86.11 
 
 		 1296 bp  63.9  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  86.11 
 
 		 1296 bp  63.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  86.11 
 
 		 1296 bp  63.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  86.11 
 
 		 1248 bp  63.9  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1184    84.72 
 
 		 1296 bp  56  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  86.67 
 
 		 1263 bp  56  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  90.91 
 
 		 1308 bp  56  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  88 
 
 		 1233 bp  52  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  87.76 
 
 		 1311 bp  50.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0172    85.71 
 
 		 1238 bp  48.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.018644  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0190    88.64 
 
 		 1239 bp  48.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>