285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1407 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1407  mercuric transport periplasmic protein MerP, putative  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2788  heavy metal transport/detoxification protein  86.27 
 
 		 100 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.863319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2871  heavy metal transport/detoxification protein  86.27 
 
 		 100 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2967  heavy metal transport/detoxification protein  85.11 
 
 		 99 aa  167  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.986526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  76.6 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  76.6 
 
 		 94 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  84.81 
 
 		 94 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  75.53 
 
 		 94 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  45.45 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  42.42 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 798 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 798 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 1182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  42.67 
 
 		 760 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  42.67 
 
 		 760 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  44.29 
 
 		 739 aa  54.3  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 1013 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 1040 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  36.62 
 
 		 798 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 946 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 937 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 837 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  38.27 
 
 		 1063 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  38.27 
 
 		 1061 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  38.27 
 
 		 1061 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 		 797 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 1021 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 1021 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  36.49 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  38.27 
 
 		 1061 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  38.27 
 
 		 1063 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  38.27 
 
 		 1061 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 758 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 836 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 826 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  41.79 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  46.77 
 
 		 849 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 1071 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  45.9 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 745 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 827 aa  50.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 841 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 		 826 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 		 816 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  45.76 
 
 		 819 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 790 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 835 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 971 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3259  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 884 aa  50.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.25 
 
 		 794 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 759 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 909 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  39.74 
 
 		 837 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  44.12 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 789 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  44.12 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  44.26 
 
 		 817 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  39.71 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  41.18 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 740 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 726 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0610  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 719 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.424082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  41.43 
 
 		 833 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  54.55 
 
 		 839 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 770 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  36.62 
 
 		 724 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 737 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  36.67 
 
 		 751 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  41.18 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 737 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2126  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 852 aa  48.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 737 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 		 811 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 777 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 765 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  35.8 
 
 		 811 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 802 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  41.79 
 
 		 819 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 		 813 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 802 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  40.85 
 
 		 905 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  35.82 
 
 		 550 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 730 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  41.79 
 
 		 792 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 739 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 833 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 750 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0311  copper-translocating P-type ATPase  38.89 
 
 		 767 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 		 826 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  45 
 
 		 792 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 785 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  45 
 
 		 826 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  39.71 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  39.71 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  39.71 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  39.71 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  38.67 
 
 		 766 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  39.71 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 757 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>