17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1398 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 30 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  96.67 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  86.67 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  86.67 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  80 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  80 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  73.33 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  76.67 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  76.67 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  70 
 
 		 158 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>