12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1067 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1067  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0905  hypothetical protein  83.44 
 
 		 151 aa  263  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.183159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0942  hypothetical protein  84.11 
 
 		 151 aa  263  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.307673  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3032  hypothetical protein  82.12 
 
 		 151 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.610873  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3396  hypothetical protein  70.07 
 
 		 151 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0171848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3471  hypothetical protein  69.34 
 
 		 151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0891  hypothetical protein  70.07 
 
 		 151 aa  206  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.23586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3594  hypothetical protein  71.53 
 
 		 151 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.232749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0091  hypothetical protein  33.56 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.766626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10613  hypothetical protein  35.04 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0092  hypothetical protein  32.48 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.905306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2545  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>