13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0171 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0171  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.563681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1089  hypothetical protein  32.95 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275676  normal  0.229611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000190076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2687  protein of unknown function DUF1047  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.95489e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000830726  hitchhiker  0.000000341922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.93337e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.906723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000351017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003445  hypothetical protein  31.03 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000947124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02330  hypothetical protein  28.74 
 
 		 149 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>