44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4859 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  249  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  249  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  99.18 
 
 
122 aa  248  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  98.36 
 
 
122 aa  245  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  98.36 
 
 
122 aa  245  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  45.37 
 
 
143 aa  94  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  39.02 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  36.8 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  39.81 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  39.18 
 
 
197 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  36.11 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  41.18 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  37.38 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  37.38 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  34.75 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  34.86 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  38.53 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  40.48 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  34.58 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  35.09 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3413  hypothetical protein  48.72 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  38.6 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  34.45 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  35.71 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  38.61 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  39.62 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  38.46 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  31.67 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  43.96 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  37.25 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  37.63 
 
 
306 aa  67.4  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  30.7 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  30.7 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  33.06 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  32.2 
 
 
163 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  32.35 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  31.03 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  33.65 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  28.85 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  36.56 
 
 
202 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  31.82 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>