14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4053 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4053  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal  0.0673668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4169  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.663653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4104  hypothetical protein  98.97 
 
 
97 aa  202  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3982  hypothetical protein  98.97 
 
 
97 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.831944  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3999  hypothetical protein  97.94 
 
 
97 aa  200  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03545  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  151  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0042  putative transport protein  67.01 
 
 
97 aa  151  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3874  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  151  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4169  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  151  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0038  putative transport protein  67.01 
 
 
97 aa  151  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03487  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  151  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4017  hypothetical protein  61.86 
 
 
97 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.677995  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5088  hypothetical protein  61.86 
 
 
97 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0518984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0040  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.525589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>