15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3865 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3865  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3798  hypothetical protein  99.08 
 
 
217 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0007  conserved hypothetical protein  45.81 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3908  hypothetical protein  45.81 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0007  hypothetical protein  45.81 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4205  hypothetical protein  45.81 
 
 
253 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.518321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03579  predicted lipoproteinC  45.32 
 
 
218 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5124  hypothetical protein  45.32 
 
 
218 aa  181  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.22364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03523  hypothetical protein  45.32 
 
 
218 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4061  hypothetical protein  45.45 
 
 
218 aa  177  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1641  hypothetical protein  31.84 
 
 
233 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3515  hypothetical protein  31.84 
 
 
233 aa  89  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1752  hypothetical protein  31.84 
 
 
233 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0026  hypothetical protein  28.99 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0670841  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4061  hypothetical protein  24.06 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>