47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0975 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1007  hypothetical protein  99.68 
 
 		 316 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.690632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0941  hypothetical protein  99.37 
 
 		 316 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.374104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1058  hypothetical protein  99.05 
 
 		 316 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1038  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.687101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0975  VirK-like protein  100 
 
 		 316 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.587318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0949  hypothetical protein  57.14 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.422443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0981  hypothetical protein  57.14 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.47492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00882  hypothetical protein  57.14 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2719  hypothetical protein  57.14 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.805745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2284  hypothetical protein  57.14 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00241499  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2453  hypothetical protein  57.14 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0233718  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00888  hypothetical protein  57.14 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2765  protein of unknown function DUF535  57.14 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0819238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1037  hypothetical protein  57.14 
 
 		 330 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1394  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1669  hypothetical protein  47.16 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2613  hypothetical protein  45.39 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1595  hypothetical protein  45.39 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2697  hypothetical protein  45.39 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2409  hypothetical protein  38.13 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1208  protein of unknown function DUF535  36.82 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4270  hypothetical protein  37.98 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2837  protein of unknown function DUF535  36.75 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2956  virulence protein  36.3 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  hitchhiker  0.00000541429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2922  hypothetical protein  35.59 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0345216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2975  virulence protein  35.59 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188395 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3078  hypothetical protein  35.59 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2892  virulence protein  35.59 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0063  hypothetical protein  35.13 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4853  hypothetical protein  35.13 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0044  hypothetical protein  35.13 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793542  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0262  hypothetical protein  34.77 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000760  VirK protein  31.14 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04886  hypothetical protein  30.14 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0935  hypothetical protein  26.86 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0127626  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2576  hypothetical protein  31.05 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2907  hypothetical protein  30.22 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3894  hypothetical protein  33.53 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831211  normal  0.569871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3138  VirK domain-containing protein  29.24 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2717  hypothetical protein  28.99 
 
 		 334 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1902  hypothetical protein  31.51 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.956039 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1515  hypothetical protein  26.25 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1361  hypothetical protein  27.44 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000275115  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0233  protein of unknown function DUF535  23.94 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1212  hypothetical protein  26.03 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1087  hypothetical protein  27.97 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0654  hypothetical protein  25.31 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>