34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0833 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0805  putative cytoplasmic protein  99.57 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.500742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0833  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0864  hypothetical protein  98.28 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0896  hypothetical protein  96.55 
 
 		 232 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3648  hypothetical protein  46.82 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3710  putative inner membrane protein  45.91 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.457915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3613  hypothetical protein  45.91 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3542  hypothetical protein  45.91 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3541  putative inner membrane protein  45.45 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00302241  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0069  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.91 
 
 		 302 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0068  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.91 
 
 		 302 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0068  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.91 
 
 		 302 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0070  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.91 
 
 		 302 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0067  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.91 
 
 		 302 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3166  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  28.32 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0778  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.21 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.796929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0632  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.06 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00570  hypothetical protein  30.06 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3012  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  30.06 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.139818  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3031  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.06 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0635  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.06 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.474806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0664  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.06 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00581  triphosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  30.06 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2317  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  31.07 
 
 		 302 aa  52  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0719  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.64 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.647877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  28.98 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2030  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  27.43 
 
 		 301 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0527  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.06 
 
 		 292 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0701  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.06 
 
 		 290 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1757  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  26.86 
 
 		 301 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0732  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.64 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0673  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.64 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0659  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.64 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0328  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  33.04 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>