46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2453 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



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Locus tag

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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2453  putative lipoprotein  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000829176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2465  putative lipoprotein  78.6 
 
 
259 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125896  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2445  putative lipoprotein  66.15 
 
 
261 aa  355  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000167543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2451  putative lipoprotein  66.41 
 
 
260 aa  353  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000265832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2423  putative lipoprotein  64.09 
 
 
259 aa  347  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186273  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2422  putative lipoprotein  60.7 
 
 
261 aa  331  9e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00662333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0090  putative lipoprotein  62.4 
 
 
255 aa  322  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0087  putative lipoprotein  62.4 
 
 
255 aa  322  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2566  putative lipoprotein  59.53 
 
 
258 aa  320  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2514  putative lipoprotein  59.53 
 
 
258 aa  320  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0088  putative lipoprotein  61.24 
 
 
255 aa  318  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0091  putative lipoprotein  61.24 
 
 
255 aa  318  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0087  putative lipoprotein  61.24 
 
 
256 aa  317  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0084  putative lipoprotein  61.24 
 
 
256 aa  317  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0461  putative lipoprotein  59.39 
 
 
261 aa  316  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.854169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0473  putative lipoprotein  59.39 
 
 
261 aa  316  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0609616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2443  putative lipoprotein  61.48 
 
 
253 aa  315  4e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00243973  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0479  putative lipoprotein  60.42 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0812956  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0467  putative lipoprotein  60.42 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2565  putative lipoprotein  59.14 
 
 
258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.471383  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2513  putative lipoprotein  59.14 
 
 
258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2559  putative lipoprotein  58.75 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.912087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2508  putative lipoprotein  58.75 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0088  putative lipoprotein  62.02 
 
 
267 aa  301  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0085  putative lipoprotein  62.02 
 
 
267 aa  301  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2447  putative lipoprotein  55.43 
 
 
253 aa  295  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00380384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2564  putative lipoprotein  57.59 
 
 
265 aa  293  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2512  putative lipoprotein  57.59 
 
 
265 aa  293  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0086  putative lipoprotein  63.29 
 
 
255 aa  285  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0089  putative lipoprotein  63.29 
 
 
255 aa  285  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0476  putative lipoprotein  53.97 
 
 
260 aa  254  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000734906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0464  putative lipoprotein  53.97 
 
 
260 aa  254  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0463  putative lipoprotein  49.61 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0475  putative lipoprotein  49.61 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000163585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0480  putative lipoprotein  48.5 
 
 
270 aa  252  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.691332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0468  putative lipoprotein  48.5 
 
 
270 aa  252  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0478  putative lipoprotein  48.29 
 
 
266 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0421464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0466  putative lipoprotein  48.29 
 
 
266 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0472  putative lipoprotein  50.38 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480051  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0460  putative lipoprotein  50.38 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.322208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0465  putative lipoprotein  47.53 
 
 
263 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0477  putative lipoprotein  47.53 
 
 
263 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257983  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0471  putative lipoprotein  46.9 
 
 
257 aa  221  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.439406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0459  putative lipoprotein  46.9 
 
 
257 aa  221  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.519251  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_0201  putative lipoprotein  33.04 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0195  putative lipoprotein  33.04 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178008  n/a   
 
 
-
 
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