44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1883 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1883  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  329  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  52.52 
 
 		 140 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  52.52 
 
 		 140 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  32.19 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  37.4 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  37.4 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  37.4 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  35.88 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  37.4 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  32.06 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  37.61 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  35.34 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  36.57 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  33.64 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  33.65 
 
 		 118 aa  62  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  31.54 
 
 		 118 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  31.54 
 
 		 118 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  31.54 
 
 		 118 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  35.61 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  32.82 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  29.58 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  27.54 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  29.92 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  31.5 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  31.5 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  33.01 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  28.03 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  30.56 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  34.45 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1827  hypothetical protein  27.56 
 
 		 114 aa  50.8  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.447916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  24.29 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  26.92 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  30.84 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  28.68 
 
 		 249 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  29.03 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  22.99 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  35.53 
 
 		 122 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  28.3 
 
 		 121 aa  45.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  26.61 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  28.68 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0796  putative acyltransferase  23.24 
 
 		 147 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1187  putative acyltransferase  23.24 
 
 		 147 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  27.2 
 
 		 130 aa  40.8  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  25.18 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>