249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1769 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1769  hemolysin III, putative  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.664722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2201  hemolysin III family channel protein  82.38 
 
 		 227 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000726691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2239  hemolysin III family channel protein  82.38 
 
 		 227 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000410283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0618  hemolysin III-like protein  54.21 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.160524  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1319  hemolysin III, putative  55.34 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  38.16 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  34.42 
 
 		 215 aa  132  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  31.42 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  37.21 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  36.02 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  35.96 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  34.12 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  31.9 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  34.47 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  29.52 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  34.47 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  35.03 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  31.25 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  34.47 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  31.86 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  30.8 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  30.8 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  33.51 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  32.29 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  34.47 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  30.8 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  31.02 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  34.47 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  33.5 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  30.88 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  30.99 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  34.93 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  30.69 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  30.84 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  31.03 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  32.98 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  32.98 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  32.2 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  32.45 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  32.45 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  32.45 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  32.98 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  32.45 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  32.45 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  32.45 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  32.51 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  33.5 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  33.33 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  33.99 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  33.5 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  34.12 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  34.12 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  34.12 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  34.12 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  34.12 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  30.69 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  32.39 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  31.25 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1993  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0837698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2360  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  32.55 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  32.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  32.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  32.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  32.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  32.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  32.54 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  32.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  32.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  32.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  33.01 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  32.84 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  32.2 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0771  hemolysin III family channel protein  33.16 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  29.7 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  30.24 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  32.34 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  32.51 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  33.5 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  32.84 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  33.18 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  32.84 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  32.84 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  32.68 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45839  predicted protein  35.26 
 
 		 563 aa  99.8  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1934  hemolysin III family channel protein  33.17 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.680237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0520  hemolysin like protein  30.77 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  31.37 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2099  hemolysin III family channel protein  33.66 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2447  hemolysin III family channel protein  33.02 
 
 		 217 aa  99  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  31.19 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  34.33 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1879  hemolysin III family channel protein  33.17 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0909  hemolysin III-like protein  30.24 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  33.18 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  32 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0531  hemolysin III  28.78 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.666008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  30.73 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  32.68 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>