More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1537 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1537  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  100 
 
 		 828 aa  1701    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000281977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  28.5 
 
 		 1476 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24.45 
 
 		 1127 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  26.82 
 
 		 1262 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  28.15 
 
 		 1214 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  27.32 
 
 		 1257 aa  171  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  29.52 
 
 		 1485 aa  171  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  26.14 
 
 		 1172 aa  171  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  27.36 
 
 		 1510 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  26.15 
 
 		 1165 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  25.97 
 
 		 1165 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  27.32 
 
 		 1194 aa  167  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  25.95 
 
 		 1171 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  25.94 
 
 		 1172 aa  166  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  26.14 
 
 		 1165 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0427  DNA polymerase III, alpha subunit  27.7 
 
 		 1216 aa  164  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  25.66 
 
 		 1165 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  26.29 
 
 		 1172 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  26.53 
 
 		 1153 aa  160  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  26.84 
 
 		 1182 aa  160  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  26.61 
 
 		 1186 aa  160  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  25.27 
 
 		 1177 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  25.9 
 
 		 1172 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1606  DNA polymerase III, alpha subunit  25.99 
 
 		 1187 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.667733  normal  0.417005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0255  DNA polymerase III, alpha subunit  25.28 
 
 		 1322 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  26.6 
 
 		 1180 aa  158  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  25.09 
 
 		 1162 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  26.03 
 
 		 1454 aa  157  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  28.22 
 
 		 1108 aa  157  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  25.51 
 
 		 1165 aa  157  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  28.03 
 
 		 1108 aa  157  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  28.03 
 
 		 1108 aa  157  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  27.46 
 
 		 1108 aa  157  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  25.52 
 
 		 1092 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  27.84 
 
 		 1108 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  28.03 
 
 		 1108 aa  157  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  28.03 
 
 		 1108 aa  157  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  28.03 
 
 		 1108 aa  157  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  27.46 
 
 		 1108 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12030  DNA-directed DNA polymerase III PolC  27.09 
 
 		 1165 aa  156  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  26.63 
 
 		 1104 aa  156  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  25.95 
 
 		 1109 aa  156  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  26.09 
 
 		 1180 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.86 
 
 		 1075 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  24.13 
 
 		 1171 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21370  DNA-directed DNA polymerase III PolC  27.41 
 
 		 1166 aa  154  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1086  DNA polymerase III subunit alpha  26.2 
 
 		 1181 aa  154  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  24.95 
 
 		 1139 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  25.37 
 
 		 1159 aa  154  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  28.41 
 
 		 1161 aa  153  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  26.05 
 
 		 1186 aa  153  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  26.48 
 
 		 1148 aa  153  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  27.01 
 
 		 1201 aa  153  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1898  DNA polymerase III, alpha subunit  25.09 
 
 		 1179 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  25.09 
 
 		 1187 aa  152  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  26.1 
 
 		 1122 aa  152  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  26.57 
 
 		 1145 aa  152  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  25.23 
 
 		 1182 aa  152  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  27.64 
 
 		 1165 aa  151  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  27.41 
 
 		 1110 aa  151  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  25.09 
 
 		 1151 aa  150  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3172  DNA polymerase III subunit alpha  24.83 
 
 		 1175 aa  150  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.450877  hitchhiker  0.0000979148 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  27.17 
 
 		 1200 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  26.17 
 
 		 1203 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0940  DNA polymerase III subunit alpha  24.42 
 
 		 1155 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  25.74 
 
 		 1163 aa  148  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1582  DNA polymerase III subunit alpha  26.17 
 
 		 1185 aa  149  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2402  DNA polymerase III subunit alpha  25.14 
 
 		 1163 aa  149  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  24.53 
 
 		 1168 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  27.17 
 
 		 1200 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  26.46 
 
 		 1200 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  25.74 
 
 		 1163 aa  148  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  27.85 
 
 		 1181 aa  148  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3501  DNA polymerase III, alpha subunit  25 
 
 		 1194 aa  148  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  26.06 
 
 		 1237 aa  147  6e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  26.14 
 
 		 1184 aa  147  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  26.02 
 
 		 1201 aa  147  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  25.09 
 
 		 1159 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  24.6 
 
 		 1162 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  24.86 
 
 		 1165 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  26.28 
 
 		 1190 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  25.28 
 
 		 1172 aa  146  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22680  DNA polymerase III, alpha subunit  25.64 
 
 		 1181 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.149072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  25.05 
 
 		 1195 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  26.14 
 
 		 1145 aa  145  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  25.83 
 
 		 1174 aa  144  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0531  DNA polymerase III, alpha subunit  26.02 
 
 		 1205 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  24.48 
 
 		 1065 aa  144  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.26 
 
 		 1115 aa  144  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  23.33 
 
 		 1158 aa  144  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4484  DNA polymerase III, alpha subunit  23.88 
 
 		 1186 aa  143  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  25.05 
 
 		 1158 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1148 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  25.99 
 
 		 1170 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  25.13 
 
 		 1178 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  24.86 
 
 		 1183 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  25.14 
 
 		 1185 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2892  DNA polymerase III alpha subunit  27.99 
 
 		 1173 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0503022  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  26.84 
 
 		 1183 aa  144  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2399  DNA polymerase III subunit alpha  26.23 
 
 		 1190 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351088  normal  0.331114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>