31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1381 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1381  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  222  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0058344  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1932  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  204  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.94494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1898  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  204  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0955  hypothetical protein  46.02 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0695  hypothetical protein  46.9 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1043  hypothetical protein  46.02 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0863  hypothetical protein  46.02 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000497885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0761  hypothetical protein  46.02 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000533819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0768  hypothetical protein  46.02 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.92086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0820  hypothetical protein  46.02 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000558445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0953  hypothetical protein  46.02 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000903896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0916  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000848961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4422  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000277472  normal  0.337498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0767  hypothetical protein  43.36 
 
 
117 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0629  hypothetical protein  41.07 
 
 
117 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1433  hypothetical protein  33.93 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1268  hypothetical protein  29.82 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000770353  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0901  hypothetical protein  35.78 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.56772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1495  hypothetical protein  30.84 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0216529  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1212  hypothetical protein  36.28 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000106466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0692  protein of unknown function DUF964  30.97 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03100  hypothetical protein  32.38 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0693  hypothetical protein  35.78 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0655  hypothetical protein  31.78 
 
 
115 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000330958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0821  hypothetical protein  26.36 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000683024  hitchhiker  0.00464217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2369  protein of unknown function DUF964  21.1 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15270  hypothetical protein  28.83 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.01889e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1376  hypothetical protein  25 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000692877  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1451  hypothetical protein  23.21 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0330  protein of unknown function DUF964  28.04 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3201  hypothetical protein  25.25 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>