More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1112 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1112  glucokinase  100 
 
 
328 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1605  ROK family glucokinase  85.98 
 
 
328 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.143197  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1639  ROK family glucokinase  85.98 
 
 
328 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.352647  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  43.77 
 
 
323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  44.38 
 
 
318 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  44.3 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  44.03 
 
 
327 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  44.03 
 
 
327 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  44.03 
 
 
327 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  44.03 
 
 
327 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  44.03 
 
 
327 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  44.03 
 
 
327 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  44.03 
 
 
327 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  43.71 
 
 
327 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  43.71 
 
 
327 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  43.4 
 
 
327 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  41.43 
 
 
317 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  41.64 
 
 
322 aa  222  9e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  41.23 
 
 
322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  39.69 
 
 
323 aa  208  9e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  39.43 
 
 
321 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  39.75 
 
 
323 aa  202  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  35.99 
 
 
315 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  35.06 
 
 
317 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  41.32 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  38.54 
 
 
314 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  35.22 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  35.22 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  36.71 
 
 
312 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  36.05 
 
 
315 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  31.21 
 
 
317 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  37.03 
 
 
313 aa  156  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.33 
 
 
322 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  38.29 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.67 
 
 
313 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  30.74 
 
 
321 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  31.75 
 
 
409 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.99 
 
 
347 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  33.85 
 
 
314 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  33.85 
 
 
314 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  31.11 
 
 
393 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.6 
 
 
352 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  30.38 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.23 
 
 
402 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.28 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  35.96 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.88 
 
 
389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  32.59 
 
 
300 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.57 
 
 
328 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  28.92 
 
 
342 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  35.42 
 
 
318 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  30.28 
 
 
420 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.84 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  31.25 
 
 
335 aa  136  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  28.66 
 
 
443 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  28.48 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.48 
 
 
401 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  33.84 
 
 
317 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.95 
 
 
406 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  29.75 
 
 
427 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.22 
 
 
316 aa  132  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.75 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.91 
 
 
396 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  33.97 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30.91 
 
 
389 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  26.17 
 
 
392 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  30.29 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.79 
 
 
410 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  33.44 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  31.45 
 
 
323 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  26.92 
 
 
389 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  32.6 
 
 
315 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  29.15 
 
 
314 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  31.33 
 
 
315 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  27.02 
 
 
395 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  30.55 
 
 
319 aa  126  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.54 
 
 
389 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  33.46 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  29.03 
 
 
402 aa  125  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  28.42 
 
 
402 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.99 
 
 
404 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  30.19 
 
 
325 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  33.72 
 
 
255 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  31.41 
 
 
292 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  31.29 
 
 
361 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  28.92 
 
 
306 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  27.64 
 
 
422 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31.18 
 
 
396 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  32.32 
 
 
310 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  30.84 
 
 
315 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  30.72 
 
 
295 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  30.72 
 
 
295 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.62 
 
 
298 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  33.64 
 
 
320 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.21 
 
 
418 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  25.08 
 
 
372 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  25.63 
 
 
401 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  27.02 
 
 
332 aa  122  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  28.3 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  29.52 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>